河北省散发腹泻病例诺如病毒基因特征分析

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摘要 摘要目的了解河北省散发腹泻病例诺如病毒的分子特征。方法收集2015年9月至2016年12月,河北省6市哨点医院散发腹泻病例粪便标本,用实时荧光反转录聚合酶链式反应(real-time reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)方法检测标本中的诺如病毒。阳性标本进行基因片段扩增,并测序进行序列比对,确定基因型。对测序所得序列与基因库中诺如病毒参考序列进行同源比对,并做进化树分析。结果共采集腹泻便样本1 240份,检出诺如病毒阳性样本58份,其中GI型5份,GII型53份。对诺如病毒阳性样品RNA进行测序,得到21条主要衣壳蛋白(VP1)区序列和17条RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA-polymerase,RdRP)区序列。经过与GenBank中诺如病毒参考序列比对,得到VP1区5种基因型,GII.4型最多(10/21),其次为GII.17型(4/21),其他还有GII.2型(3/21)、GII.3型(3/21)和GII.6型(1/21)。RdRP区有2种基因型,分别为GII.P17型(4/17)和GII.Pe型(13/17)。结论河北省感染诺如病毒散发腹泻病例以GII.4型和GII.17型为主,其他型别也有检出,需要进一步加强监测,及时发现新型毒株。
出处 《国际病毒学杂志》 2020年01期
出版日期 2020年08月10日(中国期刊网平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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