简介:DNAisthegeneticmaterialofvariousorganisms.ExtracellularDNAadsorbedorboundonsurface-activeparticlesinsoilshasbeenshowntopersistforlongperiodsagainstnucleasesdegradationandstillretaintheabilitytotransformcompetentcells.ThispaperreviewssomerecentadvancesonthebindingandtransformationofextracellularDNAinsoils,whichisfundamentaltounderstandingthenatureofthesoil,regulatingbiodiversity,andassessingtheriskofreleasinggeneticallyengineeredmicroorganisms(GEMs)aswellasbeinghelpfulfordevelopmentofthegeneticevolutionaltheoryofbacteria.Severalinfluencingfactors,suchassoilpH,ionicstrength,soilsurfaceproperties,andcharacteristicsoftheDNApolymer,arediscussed.Todate,theunderstandingofthetypeofmolecularbindingsitesandtheconformationofadsorbedandboundDNAtosoilparticlesisstillinitsinfancy.
简介:本文提出DNA序列相似度指标,建立DNA序列比对算法。首先,将水生生物DNA样本序列与现有的基因库中的DNA序列逐项比对;其次,在满足特定阈值条件下,确认样本序列的分类。利用Java编程语言来实现算法,通过MonteCarlo模拟和实际应用,验证算法的有效性。理论结果表明:在满足特定阈值条件下,通过计算DNA序列相似度,能够确定数据库中与未知DNA样本序列最相似的序列,判断样本序列的分类。模拟实验、对比研究和应用结果表明:相似度指标算法在有效判别DNA序列的分类,提高DNA序列匹配成功率,降低程序复杂度等方面具有优良特征。
简介:目前关于落叶木本果树DNA提取的材料多数为植物的叶片,叶片具有试材广泛、容易研磨、DNA产量高、质量好等优点,但也会受到季节、病虫害的影响且不耐贮藏。落叶果树枝条具有取材容易、DNA含量丰富的特点而适合在休眠季节用于提取DNA,进而加速果树分子生物学研究进程。本研究探讨了CTAB法、SDS法对休眠季节不同时期取材的葡萄、桃、樱桃、杏、苹果、银杏、柿子、枣8种落叶果树的一年生枝条DNA提取效果。结果表明:除葡萄外其他多数材料在整个休眠时期均能提出高质量的DNA,所提DNA电泳带纹清晰、亮度高,DNA产率高、质量优,可用于有关分子生物学的后续试验(RAPD分析);再DNA提取方法方面,从DNA产量和质量上来看,SDS法总体上要优于CTAB法。最后对提取中出现中存在过多的酚类、多糖和其他次生物质去除方法进行了讨论。