简介：目的：探讨高分辨率熔解曲线分析（Highresolutionmelting,HRM）技术检测结核分枝杆菌耐药突变位点的可行性。方法：对218株结核分枝杆菌进行利福平（RFP）和异烟肼（INH）的药物敏感性测定,并进行耐药基因位点的PCR扩增和测序,同时采用HRM方法检测RFP和INH耐药基因位点情况,分析HRM的敏感性和特异性。结果：218株结核分枝杆菌药敏试验结果显示,有106株（48.6%）对RFP耐药,100株（45.9%）对INH耐药,81株（37.4%）对RFP和INH均耐药。测序发现,101株（46.3%）存在RFP耐药基因的突变,107株（49.1%）存在INH耐药基因的突变。HRM检测结果显示,100株（45.9%）存在RFP耐药基因的突变,103株（47.2%）存在INH耐药基因的突变。分别以药敏试验和测序结果为标准,HRM检测RFP耐药的敏感性为94.3%（100/106）和99.0%（100/101）;特异性为97.3%（109/112）和100%（117/117）;INH耐药的敏感性为97.0%（97/100）和98.1%（103/105）;特异性为97.3%（109/112）和100%（113/113）。结论：HRM快速检测结核分枝杆菌耐药具有较高的特异性和灵敏度,能够满足临床需求。

简介：Excel是常用的电子表格处理软件，笔者采用基于Excel的VBA编程方法，编写了“多项式的三角函数拟合单峰曲线”程序，经教学科研工作中使用，获得了理想的效果。文中发表了该程序的源代码及使用方法，供广大科教人员下载使用。

简介：[目的]生态位模型在生物地理学、入侵生物学和保护生物学中具有广泛的应用，被越来越多地用于预测物种潜在分布和现实分布的研究中。本文以美国白蛾为例介绍pROC方案在生态位模型评价中的应用及其注意事项，以期对物种潜在分布预测进行合理的评价，促进生态位模型在我国的合理运用和发展。[方法]介绍ROC曲线和AUC值基本原理，总结其在生态位模型评价中的应用，从物种存在分布点和不存在分布点的可信度出发，分析AUC值用于模型评价的优点和不足，最后介绍局部受试者工作特征曲线的线下面积方案（pROC方案）来弥补传统AUC值的不足。[结果]AUC值虽独立于阈值，但因其综合灵敏度和特异度，而屏蔽这2个指标各自的特征，不能分别评估预测结果的灵敏度和特异度，同时对遗漏率和记账错率不能进行权衡，会误导使用者对模型的评价。与AUC值相比，ROC曲线的形状更具有价值，蕴含丰富的模型评价信息。[结论]模型评价需要将灵敏度和特异度区别对待，ROC曲线形状比AUC值在生态位模型评价中更为重要，pROC方案相对于传统AUC值具有优势，但容易对过度模拟做出不当判断。模型评价与作者研究目的密切相关：当以预测物种潜在分布为目的时（如入侵物种潜在分布、气候变化对物种分布的影响和谱系生物地理学），模型评价应当给予灵敏度（或者遗漏率）更多的权重；当以预测物种现实分布为目的时（如保护区界定和濒危物种引入），模型评价应当给予灵敏度和特异度同等的权重。

简介：【背景】多样性比较是评价转基因作物对生物群落影响的标准参数之一。以往用于描述多样性的指数很多，但这些指数各有优缺点，生物学解释不全面。运用现代生物多样性表示方法，能够描述更复杂情况下的多样性关系。本文主要介绍了Rényi多样性指数曲线在生物安全研究中的应用。【方法】Rényi多样性指数曲线与以往常用的一维多样性指数不同，当其等级参数为某些特定值时代表了几个著名的多样性指数，该方法可较为确切地评价复杂的生物群落的多样性。本文在介绍其计算公式后，通过比较河北省2种转Bt基因棉田（孟山都33B和中棉30，均未施农药）以及常规管理（施用农药）和综合治理（IPM，施用农药和释放赤眼蜂相结合）条件下非转基因棉田的蜘蛛群落，证明了该方法的适用性。【结果】Rényi多样性指数曲线分析表明了所有可能的互作类型：1个明确的多样性排序以及2类棉田蜘蛛群落间不同的潜在关系。Rényi指数分析表明，在供试棉田中，中棉30棉田的蜘蛛多样性指数最高，其他3种棉田蜘蛛的多样性高低则难以一概而论。蜘蛛稀有种的多样性以孟山都33B棉田最高，IPM和常规棉田次之；蜘蛛常见种的多样性以IPM棉田最高，常规棉田和孟山都33B棉田次之。【结论与意义】Rényi多样性指数可用于生物群落多样性的综合评价，并可用于评价不同管理措施对生物多样性的影响。该方法弥补了仅用单一数量参数评价多样性的传统方法的缺陷，将不同参数整合成一个具有内在关联的概念框架。