简介：摘要随着高通量测序技术的发展，组学研究中获得的高维海量数据对统计分析提出了新的要求。在此情况下，传统的单个假设检验理论不再适用，多重假设检验问题日益得到重视。本文着重介绍多重假设检验中常用的3种错误测度——总体/族错误率(FWER)、错误发现率(FDR)和阳性错误发现率(pFDR)及其控制过程在放射生物组学数据分析中的应用，以期为放射生物学数据的统计分析提供参考。

简介：微生物组学大数据在生态环境、人类健康和疾病研究方面都起到了重要作用。通过数学、统计等数据挖掘方法,从高维复杂数据中提取有用信息,是微生物组学大数据建模和分析的关键问题。本文分析了微生物组学大数据的特点,对当前数据分析和计算研究中存在的热点和难点进行了探讨分析,并综述了当前微生物组学大数据模式挖掘、网络重建与分析的研究概况。

简介：摘要目的基于肺癌患者胸部定位CT图像进行筛选与放射性肺炎发生相关的放射组学特征，构建机器学习模型，探讨放射组学在预测放射性肺炎发生中的价值。方法回顾性分析行根治性调强放疗的Ⅲ期非小细胞肺癌患者86例，通过随访影像学资料及临床信息将其进行放射性肺炎分级，并收集其定位CT图像。将全肺作为感兴趣体积进行放射组学特征的提取，分析与发生放射性肺炎有关的放射组学特征及临床、剂量学特征。利用支持向量机进行模型构建，通过五折验证方式检测模型预测性能。结果提取出放射组学特征1029个，通过方差分析及LASSO方法共得到与发生放射性肺炎有关的放射组学特征5个。单纯利用放射组学特征构建模型的测试集曲线下面积(AUC)＝0.67，利用放射组学特征结合临床、剂量参数构建模型的测试集AUC＝0.71。结论在通过利用Ⅲ期非小细胞肺癌患者的定位CT图像进行构建的放射组学模型有预测放射性肺炎发生的潜能，加入临床及剂量参数后可进一步提高预测效能。

简介：近十年来,尽管我们对病理学的了解是突飞猛进,但许多疾病的潜在机制仍不清楚.基因组研究通过基础实验和一系列复杂的研究工具发现了疾病发展过程中所存在的分子异常,从而为阐明疾病的发生机制提供了一个新的时机.本综述将举例说明基因组研究提高了我们对分子病理学的理解,并对一般复杂性疾病的研究具有潜在的优势.

简介：无

简介：《基因组学与应用生物学》（ISSN1674-568X，CN45—1369／Q）是由广西大学主管和主办，公开发行的月刊科学期刊，创刊于1982年，由北京大学教授朱玉贤院士任主编，广西大学教授陈保善博士和海南省热带农业资源研究所所长方宣钧博士任执行主编。

简介：摘要目的分析探讨肺癌和食管癌易患放射性肺炎(RP)患者的放射组学共同特征，建立能够同时预测两种肿瘤放疗后发生RP的预测模型。方法回顾性分析行根治性放疗的Ⅲ期肺癌和Ⅲ期食管癌各100例，依据随访影像学资料及临床信息进行RP分级，并收集其定位CT图像，将全肺作为感兴趣区域进行放射组学特征的提取，分析与RP相关的放射组学特征及临床、剂量学特征，利用机器学习进行模型构建。结果提取出放射组学特征1691个，肺癌和食管癌患者经过方差分析、最小绝对值收敛和选择算子降维后与RP相关的放射组学特征分别为8个和6个，其中相同的参数为5个。使用随机森林构建预测模型，将肺癌和食管癌分别交替作为训练集和验证集，食管癌和肺癌作为独立验证集曲线下面积分别为0.662和0.645。结论构建肺癌和食管癌患者发生RP的共同预测模型是可行的，但还需进一步扩充样本量，并且纳入临床和剂量学参数增加其准确度、稳定性和泛化能力。

简介：摘要经过包括放疗在内的多学科治疗，多形性胶质母细胞瘤中位生存期始终停留在1年左右。胶质瘤干细胞基因组和蛋白质组的异质性是影响预后的根本原因，依据蛋白质组学制定针对关键放射抗拒蛋白的增敏研究有望改善多形性胶质母细胞瘤预后。本文通过Pubmed等数据库查阅了近十年来的相关文献，系统地讨论了各种常用蛋白质定量技术、用于数据处理的工具及其在胶质瘤干细胞放射抗拒和放射增敏中的进展。

简介：摘要目的探讨剂量组学在预测肺癌根治性放疗患者放射性肺炎发生中的应用潜能。方法回顾性收集行根治性放疗的314例肺癌患者的临床资料、放疗剂量文件、定位及随访CT图像，根据临床资料及影像学随访资料对放射性肺炎进行分级，提取全肺的剂量组学特征，构建机器学习模型。应用1000次自助抽样法（bootstrap）的最小绝对值收敛和选择算子嵌套逻辑回归（LASSO-LR）及1000次bootstrap的赤池信息量准则（AIC）向后法筛选与放射性肺炎相关的剂量组学特征，随机按照7∶3划分为训练集及验证集，应用逻辑回归建立预测模型，并应用ROC曲线及校正曲线评价模型的性能。结果共提取120个剂量组学特征，经LASSO-LR降维筛选得到12个特征进入“特征池”，再经过AIC向后法筛选，最终筛选出6个剂量组学特征进行模型构建，训练集AUC为0.77（95%CI为0.65~0.87），独立验证集AUC为0.72（95%CI为0.64~0.81）。结论利用剂量组学建立的预测模型具有预测放射性肺炎发生的潜力，但仍需继续纳入多中心数据及前瞻性数据进一步挖掘剂量组学的应用潜能。

简介：《基因组学与应用生物学》,期刊曾用名《广西农业大学学报》、《广西农业生物科学》,创刊于1982年。从2009年开始,《广西农业生物科学》更名为《基因组学与应用生物学》,已入编《中文核心期刊要目总览》2011年版(即第六版)之综合性农业科学类的核心期刊,是中国科学引文数据"中国期刊方阵",先后被国际知名检索系统——英国国际农业与生物科学研究中心(CABI)、美国《化学文摘》(CA:JYYSAZ)、美国《剑桥科学文摘:自然科学》(CSA:NS)、英国《动物学记录》(ZR)和俄罗斯《文摘杂志》(AJ)等收录。

简介：《基因组学与应用生物学》,期刊曾用名《广西农业大学学报》、《广西农业生物科学》,创刊于1982年。从2009年开始,《广西农业生物科学》更名为《基因组学与应用生物学》,已入编《中文核心期刊要目总览》2011年版(即第六版)之综合性农业科学类的核心期刊,是中国科学引文数据"中国期刊方阵",先后被国际知名检索系统——英国国际农业与生物科学研究中心(CABI)、美国《化学文摘》(CA:JYYSAZ)、美国《剑桥科学文摘:自然科学》(CSA:NS)、英国《动物学记录》(ZR)和俄罗斯《文摘杂志》(AJ)等收录。

简介：摘要阐明病原微生物致病基因及其产物对于了解其致病性至关重要。由于致病机制复杂，因此有必要了解微生物细胞内哪些基因与体内定居有关、哪些与体内持续感染有关、哪些与毒力有关。如果能对病原微生物进行全基因测序，配合现代生物信息软件对基因顺序加以分析，就能对致病基因及产物、病原菌与宿主的关系以及病原菌引起的临床后果作出准确快速的判断。

简介：Biology（《国际放射生物学杂志》），SCI收录杂志，ISSN：0955—3002，2012年影响因子1．895。主要发表研究原著，综述，简短通讯，技术报告，迷你综述，会议报告，给编辑的信，书评等类型稿件。

简介：摘要：生物信息学是一个跨领域学科，其领域涵盖了：计算机科学、数学、统计学、生物学等学科，在所有生物学发展的今天，生物信息学起到了至关重要的作用，它为其他生物学科提供了处理大数量级的生物数据的工具以及可应用的软件。蛋白质组学作为“组学”(Omics）之一是基于现代快速累积的生物数据而产生的专业学科，在其基本的蛋白质相关研究中离不开生物信息学技术的支持。本文就生物信息学技术在蛋白质结构预测分析中的发展和应用做出综述。

简介：[摘要]本篇文章对基于经典放射组学在乳腺导管内疾病诊疗中的最新应用进行了系统综述。文章首先介绍了传统影像学检查在乳腺导管内疾病诊疗中的局限性和挑战，而后引入乳腺放射组学的概念、工作流程及其在乳腺导管内疾病诊断中的优势，包括影像数据收集、预处理、感兴趣区域分割、特征提取、模型构建等步骤。其次，分析了放射组学在乳腺导管内疾病诊疗中的最新应用。放射组学技术通过结合定量影像特征与机器学习，改善了乳腺病变的精确诊断和个性化治疗方案制定。同时，文章也讨论了放射组学在乳腺导管内疾病诊疗中最新进展，强调了其在乳腺疾病早期检测、精确诊断以及预后评估方面的潜力。综上，经典放射组学为乳腺疾病的精准诊疗提供了新视角和技术支持。

简介：随着蛋白质组学研究技术的发展,微生物蛋白质组学研究具有突破性的进展。简要介绍蛋白质组学的分类,概括5种蛋白质组学技术,综合分析极端微生物、放线菌、病原菌以及群体微生物蛋白质组学研究及应用的最新进展。

简介：摘要科学研究结果的“再现性”问题目前已成为备受关注的焦点。放射生物学是研究电离辐射对活体组织生物效应的一门医学科学，也存在着严重的“再现性”问题，其中一个重要原因是物理剂量的不准确或缺乏剂量学报告的完整描述。剂量测定指南、规范与建议的使用，如物理剂量报告规范化评分系统，有助于提高放射生物学研究中物理剂量的规范性和准确性。本文对目前为改善放射生物学和放射物理学的合作、提高放射生物学研究中物理剂量规范性的各项指南和建议进行评议，为提高放射生物学研究的可再现性提供参考。

简介：摘要目的构建乳腺癌类器官培养体系并对其进行组织学表征与初步放射生物学特征研究。方法体外培养不同分子分型乳腺癌细胞系和肿瘤组织细胞形成乳腺癌类器官，对其进行组织结构表征并利用Ki-67、ER、PR、Her2指标进行免疫组化染色；对三阴性乳腺癌患者组织及乳腺癌细胞系形成的类器官进行4、8 Gy照射处理，观测照射后0、24、48、96 h的乳腺癌类器官个数以及直径变化来评估放射对类器官的杀伤情况。结果乳腺癌细胞系和患者来源组织在6 d左右形成类器官结构；HE染色显示微结构，标志物表达具有空间异质性，肿瘤来源类器官与原组织的标志物表达具有相似性；照射处理MCF-7乳腺癌类器官后，生长停滞，部分形成的类器官崩解消失，48~96 h，逐渐恢复增殖趋势；MDA-MB-231乳腺癌类器官呈现辐射耐受和生长停滞，但结构没有明显改变，96 h仍未观察到恢复趋势；选取的三阴性患者组织来源的类器官也呈现辐射耐受，照射后类器官仍持续生长且结构没有明显改变，但生长趋势明显小于未照射组。结论不同来源与不同分子分型的乳腺癌细胞经体外培养形成的乳腺癌类器官具有微结构与异质性，可以反映来源组织标志物表达情况并展现不同的放射抵抗能力，三阴性乳腺癌来源的类器官更加耐照射。

简介：新的薄扫CT已用于CT血管造影，它已迅速取代了导管造影术。弥散-加权MRI促进缺血性卒中的早期诊断。MRI序列越来越倾向于显示特异的病理学改变。数字化MRI和放射影像学的计算机重建提供“三维”的在屏显示。

简介：摘要目的评价基于多参数磁共振成像(multiparameter magnetic resonance imaging，MP-MRI)的放射组学特征对上皮性卵巢癌腹膜转移的预测价值。材料与方法回顾性收集86例上皮性卵巢癌患者纳入研究，所有患者均行轴位脂肪抑制T2加权成像(fat suppression-T2 weighted imaging，FS-T2WI)、扩散加权成像(diffusion-weighted imaging，DWI)和动态增强(dynamic contrast enhanced，DCE)-T1WI扫描，从每个患者术前FS-T2WI、DWI和DCE-T1WI图像中提取定量成像特征，建立放射组学模型、临床模型；结合放射组学特征及临床病理危险因素，构建放射组学诺模图，通过受试者工作特性曲线、AUC、校准曲线和临床实用性来评估该放射组学诺模图的预测性能。结果来自MP-MRI组合序列的放射组学模型比单独来自FS-T2WI、DWI和DCE-T1WI的模型具有更高的AUC (0.865 vs. 0.749、0.765、0.736)。诺模图(0.953)显示出比临床模型(0.819)和组学模型(0.865)更好的诊断效果。结论基于MP-MRI组合序列的放射组学诺模图对腹膜转移显示出良好的预测准确性，可用于术前识别上皮性卵巢癌患者的腹膜转移。