为了解烟草内生细菌的多样性,采用改良的NA培养基和稀释平板法从不同生长期的烟草的根、茎、叶中分离得到127株内生细菌。利用细菌16SrDNA特异引物扩增得到16SrDNA的部分片段,长约700bp,分别用内切酶MspⅠ、HaeⅢ、AfaⅠ、HinfⅠ对扩增产物进行限制性酶切。16SrDNAPCR-RFLP分析中,在100%相似性水平处,除了cj23、ty16、cg23、wy6、cj25、wy13、my23、ty7、cj14、cg25、cg2、cj13、my11,my27单独成群外,其余菌株分为15个分类操作单元,其中Otu1、Otu2,Otu27类群最大,分别包括了27、18,26个菌株。对29个代表菌株16SrDNA序列系统发育分析表明,这些菌株主要分布于芽孢杆菌（Bacillus）分支,其余菌株分布于葡萄球菌属（Staphylococcus）、微杆菌属（Microbacterium）、单胞菌属（Sphingomonas）、中华根瘤菌属（Sinorhizobium）、土壤杆菌属（Agrobac-terium）、根瘤菌属（Rhizobium）、纳西杆菌属（Naxibacter）、贪铜菌属（Cupriavidus）、寡养食单胞菌属（Stenotrophomonas）、不动杆菌属（Acinetobacter）、假单胞菌属（Pseudomonas）、肠杆菌属（Enterobacter）、泛菌属（Pantoea）、克雷伯菌属（Klebsiella）、Bifissio属系统发育分支。通过Shannon多样性指数对不同生长期分离到的菌株进行多样性分析和比较,结果表明团棵期叶片中分离到的内生细菌多样性最大,随后是旺长期,苗期次之,成熟期最小。
