2008年4月科技部、财政部、国家税务总局联合制定了《高新技术企业的认定管理办法》(以下简称《认定办法》)和《高新技术企业认定管理工作指引》(以下简称《工作指引》),对高新技术企业的认定进行了规范。另外,中注协亦于2008年11月12日发布《高新技术企业认定专项审计指引》(以下简称《审计指引》),在《审计指引》的具体指导下,会计师事务所已开始大量承接高新技术企业认定专项审计业务,自认定开始已经有越来越多符合条件的企业申请认定为高新技术企业,并享受高新技术企业的相关税收优惠,然而在我们认定审计和检查中,发现仍有很多企业存在不同问题。本文就此进行探讨与分析。