焦磷酸测序法和Sanger测序法检测丙型肝炎病毒基因分型的方法学比较

焦磷酸测序法和Sanger测序法检测丙型肝炎病毒基因分型的方法学比较

郭磊

郭磊

（河北省沧州市中心医院检验科；河北沧州061001）

【摘要】目的分析并焦磷酸测序法与Sanger测序法检测在丙型肝炎病毒基因分型中的应用情况。方法选取2018年3月——2018年11月期间100例丙型肝炎患者，收集其血浆标本，分成相等的2份，其中1份采用焦磷酸测序法进行检测，另外1份采用Sanger测序法检测，对2种检测方法在丙型肝炎病毒基因分型结果进行对比。结果通过焦磷酸测序法和Sanger测序法对HCV-RNA进行基因分型，100例标本共有93例结果一致，其余7例结果不一致，一致率达到93.0%；焦磷酸测序法和Sanger测序法在高病毒载量检出率对比上无明显差异（P＞0.05）；焦磷酸测序法和Sanger测序法在低病毒载量检出率对比上存在明显差异性（P＜0.05）。结论焦磷酸测序法对丙型肝炎患者开展病毒基因分型，检测结果可靠、准确，与Sanger测序法相比，焦磷酸测序法敏感度更高。

【关键词】焦磷酸测序；Sanger测序；丙型肝炎；病毒基因分型

[中图分类号]R2[文献标号]A[文章编号]2095-7165（2019）03-0210-01

1资料与方法

1.1一般资料

选取100例丙型肝炎患者作为观察对象，所选病例均符合相关诊断操作标准[1]，病患本人意识清晰，能够配合相关工作。本组100例患者中，男性56例，女性44例，年龄20-60岁，平均年龄（42.36±3.92）岁。研究内容符合伦理要求，通过医学伦理委员会审查。

纳入标准：（1）符合诊疗规范者；（2）自愿参与且知情同意者；（3）无严重脏器功能损伤者；（4）病历资料完整者。病例标准：（1）合并心肺功能、肝肾功能严重损伤者；（2）合并器质性病变、造血系统、免疫系统严重疾病者；（3）合并精神类疾病者，如精神分裂症、抑郁症等；（4）妊娠及哺乳期妇女；（5）诊断依从性较差者；（6）合并交流障碍者。

1.2研究方法

收集100例丙型肝炎患者血浆标本，分成相等2份，1份开展焦磷酸测序检测，1份实施Sanger测序法检测。通过对比分析，对焦磷酸测序法和Sanger测序法的HCV-RNA基因分型结果进行记录和统计，分析检测结果。同时，对2种方法在高病毒载量（HCV-RNA病毒载量＞104IU/mL）和低病毒载量（HCV-RNA病毒载量＜104IU/mL）[2]检出率进行对比，做好详细分析。

1.3统计方法

采用spss18.0软件，计量资料用（）表示，采用t值检验。计数资料则用（%）表示，采用χ2值检验，P＜0.05差异有统计学意义。

2结果

2.1检测结果分析对比

通过焦磷酸测序法和Sanger测序法对HCV-RNA进行基因分型，100例标本共有93例结果一致，其余7例结果不一致，一致率达到93.0%，详见表1。

3讨论

丙型肝炎主要由HCV病毒引发，可导致患者肝脏受累，同时其他器官也可能受到累及，如骨髓、肾脏等，是一种全身性疾病。由于临床症状不够明显，往往容易忽视病情，导致疾病进展为慢性丙型肝炎，如未接受系统性抗病毒治疗，也会导致病情发展为肝硬化及肝癌，对患者身心健康带来严重影响。

由于不同基因型抗病毒治疗方案存在很大差异，因此及时对患者丙型肝炎病毒基因进行准确分型，具有现实意义[3]。本研究选取100例丙型肝炎患者作为观察对象，对比分析不同检测方法的分型情况，结果显示：焦磷酸测序法和Sanger测序法共有93例结果一致，其余7例结果不一致，一致率达到93.0%，说明2种测序方法诊断丙型肝炎，在病毒基因分型上无明显差异。通过表2中内容可以看出，2种检测方法高病毒载量病毒检出率均为100.0%，但是焦磷酸测序测出低病毒载19例，Sanger测序测出低病毒载13例，11例结果相同，说明在病毒分型方面，焦磷酸测序敏感性更高。

综上所述，通过对比发现，焦磷酸测序在丙型肝炎病毒分型方面，敏感性更高，且其能够开展甲基化分析。结合定量检查结果，若HCV-RNA病毒载量＜104IU/mL，则优先考虑采用焦磷酸测序方法。

参考文献

[1]徐鹤翔,郑吉顺,解俊侠,等.合肥地区丙型肝炎病毒基因分型分布特征[J].肝脏,2019,24(01):81-83.

[2]周侃,魏娟,周迪.新疆地区丙型肝炎患者血HCV-RNA水平及基因分型分析[J].中国病原生物学杂志,2018,13(12):1397-1400.

[3]徐鲁,冯家立,章莉莎.武汉市某医院就诊患者丙型肝炎病毒抗体与基因分型结果分析[J].中西医结合肝病杂志,2018,28(06):366-369.