基因芯片法与常规检测法在食源性疾病中的应用

  基因芯片法与常规检测法在食源性疾病中的应用

林毅

山东省泰安市东平县疾病预防控控中心 山东省泰安市 271500

【摘要】目的：探究食源性疾病应用常规检测法及基因芯片检测法的应用效果。方法：选取2019年5月至2020年5月我中心收到84例食源性疾病患者的样本，依据检测方法分为对照组与试验组，对照组检测方法以常规检测为主，试验组检测方法以基因芯片为主，分析两组检测时间与检测阳性率。结果：试验组共检测出49例病原菌，其中1例大肠埃希菌，26例痢疾杆菌，7例副溶血弧菌，3例金黄色葡萄球菌，12例沙门菌，检出率为58.33%；对照组共检测出27例病原菌，2例金黄色葡萄球菌，3例副溶血弧菌，18例痢疾杆菌，4例沙门菌，检出率为32.14%，试验组检出率较对照组高，有统计学差异，P＜0.05；试验组检测时间较对照组短，有统计学差异，P＜0.05。结论：食源性疾病检测应用基因芯片法能够快速诊断病原菌，诊断检出率高，实现疾病早期诊断，对于临床治疗起到十分重要作用。

【关键词】常规检测；基因芯片；食源性疾病

Application of gene chip method and routine detection method in food-borne diseases

Lin Yi Disease Prevention and Control Center of Dongping County, Tai'an City, Shandong Province 271500

【Abstract】Objective: To explore the application effects of conventional detection methods and gene chip detection methods for foodborne diseases. Methods: From May 2019 to May 2020, our center received samples of 84 patients with food-borne diseases, and they were pided into a control group and a test group according to the detection method. Methods Based on gene chips, the detection time and positive rate of the two groups were analyzed. Results: A total of 49 pathogenic bacteria were detected in the test group, including 1 Escherichia coli, 26 Shigella, 7 Vibrio parahaemolyticus, 3 Staphylococcus aureus, and 12 Salmonella. The detection rate was 58.33%; A total of 27 pathogenic bacteria were detected in the control group, 2 cases of Staphylococcus aureus, 3 cases of Vibrio parahaemolyticus, 18 cases of dysentery bacillus, and 4 cases of Salmonella. The detection rate was 32.14%. There is a statistical difference, P<0.05; the detection time of the test group is shorter than that of the control group, there is a statistical difference, P<0.05. Conclusion: The application of gene chip method in the detection of foodborne diseases can quickly diagnose the pathogenic bacteria, and the detection rate is high. The early diagnosis of the disease plays an important role in clinical treatment.

【Keywords】 routine testing; gene chip; foodborne disease

食源性疾病给人类生命健康构成严重威胁，现阶段已经成为世界各个国家共同关注的疾病之一。部分国家食源性疾病发病率较高。多发于免疫力低、婴幼儿及老年群体，致死率较高^[1]。多种因素均可引发食源性疾病，如食用化学污染或有毒生物、细菌、寄生虫等食物与水等。尽早确定病原菌类型，能够有效预防食源性疾病。常规检测方法以平板培养为主，被广泛应用于临床，但该方法存在诸多弊端如灵敏度低、操作量大及培养时间长等，临床中应用受到限制。基因芯片法作为全新的一种生物学检测技术，原理为检测基因序列鉴定细菌，以促进病原菌检测灵敏度与准确度提升^[2]。本研究选取我中心收到84例食源性疾病患者的样本，采用不同方式检测，分析其检测准确度，现报告如下。

1 资料与方法

1. 1. 临床资料

选取2019年5月至2020年5月我中心收到84例食源性疾病患者的样本，满足食源性疾病相关诊断标准。年龄4～56岁，平均年龄（31.48±6.72）岁，男女比为51:33。取患者新鲜粪便进行检测，依据检测方法分为对照组与试验组。

1. 2. 方法

对照组病菌检测仪常规培养为主，取3～4g患者新鲜粪便，置于革兰阴性浓缩肉汤培养基，并进行接种，37℃条件下培养24h，对菌落产生情况进行观察。若产生菌落，将菌落与动力-吲哚-尿素及霍乱双塘铁琼脂培养基接种，37℃条件下分离培养病原菌，培养鉴定细菌严格依据相关操作规范。

试验组检测病原菌以基因芯片法为主，取3～4g患者新鲜粪便，提取细菌DNA，操作以说明书为准。-20℃冰箱内保存提取细菌DNA，应用基因芯片与全自动病原菌检测系统检测细菌DNA。

1. 3. 观察指标

观察记录两组检测病原菌时间及病原菌检出率情况，应用统计学软件进行分析。

1.4 统计学分析

检测病原菌时间及病原菌检出率应用统计学软件分析，以SPSS23.0统计学软件为主，检测病原菌时间比较用t检验；病原菌检出率比较用χ²检验；以P＜0.05代表有统计学差异。

2 结果

2.1 两组检测病原菌时间对比

试验组检测时间较对照组短，有统计学差异，P＜0.05，见表1。

表1 两组检测病原菌时间对比（h）

2.2 两组检测病原菌阳性率对比

试验组共检测出49例病原菌，其中1例大肠埃希菌，26例痢疾杆菌，7例副溶血弧菌，3例金黄色葡萄球菌，12例沙门菌，检出率为58.33%；对照组共检测出27例病原菌，2例金黄色葡萄球菌，3例副溶血弧菌，18例痢疾杆菌，4例沙门菌，检出率为32.14%，试验组检出率较对照组高，有统计学差异，P＜0.05，见表2。

表2 两组检测病原菌阳性率对比[n（%）]

3 讨论

全球范围内常见的一种疾病为细菌性食源性疾病，自全球经济一体化以来，各个国家展开进出口贸易，尤其是食品贸易，增加了食源性疾病发生可能。在大多国家中食源性疾病发病率较高，在我国将食源性疾病纳入传染病中，该疾病多发于免疫力较低、婴幼儿及中老年人群，致死率较高，给人类生命健康构成严重威胁^[3]。引发食源性疾病的主要因素包括两种，其一，进食化学物质污染的食物或水；其二，进食有毒生物、细菌、寄生虫及病毒污染的食物或水。有研究指出，常规检测法内容为生化反应、分离培养、血清学试验、平板培养等，且具备操作简便、成本低等优势，在临床中受到广泛应用^[4]。其中最常用的为平板培养法，然而由于其灵敏度较低、工作量大加之培养时间长，难以符合食源性疾病防治要求。有研究指出平板培养法检测细菌检出率约为30%，检测时间＞48h，这给早期诊断食源性疾病带来严重影响。近几年来，分子生物学及遗传学技术的迅速发展，检测病原菌方式不断创新，已经发展至基因水平检测^[5]。基因芯片发是现代生物学检测技术的一种，在检测基因序列后能够有效鉴定细菌，以促进病原菌检测灵敏度与准确度提升。基因芯片技术作为病原菌检测的一种全新方式，具备诸多优势，如检测速度快、敏感性高及通量高等^[6]。较传统基因侧学而言，基因芯片检测速度快，范围广，能够对多个样本进行检测，实现了快速、高效诊断病原菌。

本研究结果发现，试验组病原菌检测时间较对照组低，有统计学差异。提示基因芯片法可快速检测病原菌。另外，试验组共检测出49例病原菌，其中1例大肠埃希菌，26例痢疾杆菌，7例副溶血弧菌，3例金黄色葡萄球菌，12例沙门菌，检出率为58.33%；对照组共检测出27例病原菌，2例金黄色葡萄球菌，3例副溶血弧菌，18例痢疾杆菌，4例沙门菌，检出率为32.14%，试验组检出率较对照组高，有统计学差异。结果证明食源性疾病经基因芯片检测检出率较高，有利于早期诊断食源性疾病。

综上所述，食源性疾病检测应用基因芯片法能够快速诊断病原菌，诊断检出率高，实现疾病早期诊断，对于指导临床早期治疗起到十分重要作用。

参考文献：

[1]刘莹.基因芯片法与常规检测法在食源性疾病中的应用对比分析[J].食品安全质量检测学报,2019,10(19):6478-6482.

[2]廖力,谢照聪.食源性疾病暴发事件中快速检验方法的探讨[J].中国医药指南,2019,17(21):297-298.

[3]苗升浩,许猛,王悦然,张娟,吴玲.2015-2017年徐州市哨点医院食源性疾病监测结果分析[J].现代预防医学,2018,45(24):4500-4503+4512.

[4]张作杰.食源性疾病监测中副溶血性弧菌现场快速检测方法的建立与应用[J].现代食品,2018(07):144-145+148.

[5]徐奋奋,金晓霞,黄亚琴.食源性疾病监测中副溶血性弧菌现场快速检测方法的建立与应用[J].中国卫生检验杂志,2017,27(21):3089-3091.

[6]苗升浩,张娟,吴玲,薛诚.2013-2014年徐州市食源性疾病哨点医院监测结果分析[J].实用预防医学,2017,24(03):352-354+385.