1 邵阳市疾病预防控制中心微生物检验科 422000
【摘要】目的:观察分析实时荧光定量PCR与细胞培养在流感病毒检测中的应用效果。方法:于2019年01月--2020年12月采集的2605例疑似流感样本作为课题对象,均进行实时荧光定量PCR检测、细胞培养检测。对比分析两种不同方法获得的阳性检出率。结果:细胞培养阳性检出率明显低于实时荧光定量PCR阳性检出率(p<0.05)。707例流感阳性样本中分离获得113株病毒,占比15.98%;1898例流感阴性样本中未分离获得病毒株,占比0.00%,实时荧光定量PCR法获得的流感阴性样本分离率明显低于阳性样本分离率(p<0.05)。根据细胞培养结果,实时荧光定量PCR特异性100.00%。结论:在流感病毒检测过程中,实时荧光定量PCR法具有更高的应用价值,操作简单、耗时快、特异度高,适合于常规病毒检测以及应急检测工作中。细胞培养有助于临床获取病毒株,以便于临床深入研究病毒基因特性、抗原性、耐药性。
【关键词】实时荧光定量PCR;细胞培养;流感病毒;检测效果
流感指的是流行性感冒,是因为人体感染流感病毒所致的一种呼吸系统疾病,在现代临床中普遍可见,具有发病率高、传播范围广、传染速度快等特点,可导致患者高热不退、全身酸软无力、疼痛不适、寒战,十分不利于患者安全健康。为了临床针对性治疗流感,有必要及时检测,深入分析流感病毒株的基因特性、构成、抗原性,以免流感大范围扩散[1]。细胞培养、胶体金快速检测等技术,在现代临床应用广泛。实时荧光定量PCR相比于常规PCR而言,环保型更强,具有更高的特异性以及更强的自动化检测特点。此种技术以扩增形式,对每个循环产物的荧光信号产生作用,以此来增强信号,结束一个循环后,便会被信号收集,以便于临床通过荧光信号轻度的变化构建曲线图[2]。此次研究以2605例疑似流感样本作为课题对象,对比分析了实时荧光定量PCR与细胞培养的检测价值,以供临床参考。
1.一般资料与方法
1.1一般资料
本课题纳入观察对象2605例疑似流感样本,纳入时间2019年01月--2020年12月,所有采集的疑似样本均在24h之内送检,若是24h之内无法送检,则需要存储于-70℃环境下。
1.2方法
所有疑似流感样本均进行实时荧光定量PCR检测、细胞培养检测,其中(1)实时荧光定量PCR检测。准备实时荧光定量PCR检测仪器(美国Thenmo公司ABI7500Fast)、来自于硕世生物科技有限公司的PCR反应试剂、流感病毒核酸提取盒(西安天隆公司的核酸提取试剂)。50℃环境下不断扩增30min,给予一次循环;然后在95℃环境下不断扩增5min,给予一次循环;再然后基于95℃环境下不断扩增10s,55℃环境下不断扩增40s,总共循环45次。收集荧光,基于55℃环境之下检测荧光信号强度。(2)细胞培养。根据2018年版《流行性感冒诊疗方案》提出的流感病毒分离鉴定要求,进行相应的操作。选取MDCK细胞,在流感样本的病毒培养液之中置入10000U/ml双抗,认真查看细胞变化,结合红细胞凝集试验,对流感样本的病毒培养液进行检测,如果红细胞凝集试验结果的滴度为1:8或者是超过1:8,进一步通过相关型别标准血清,开展HI试验(红细胞凝集抑制试验),明确流感病毒型别、亚型。
1.3数据统计处理
统计学软件以spss22.0版本为主,进一步检验分析本研究课题获得的计数信息,均以%(率)形式表述并实施X2检验,根据细胞培养结果,获得实时荧光定量PCR特异性与灵敏度,数据差异判定结果以P值描述,以(P<0.05)表示统计学意义。
2.结果
2.1观察细胞培养与实时荧光定量PCR阳性检出率 见表1
细胞培养阳性检出率4.34%明显低于实时荧光定量PCR阳性检出率27.14%(p<0.05)。
707例流感阳性样本中分离获得113株病毒,占比15.98%;1898例流感阴性样本中未分离获得病毒株,占比0.00%,实时荧光定量PCR法获得的流感阴性样本分离率明显低于阳性样本分离率(p<0.05)。根据细胞培养结果,实时荧光定量PCR特异性100.00%。
表1 细胞培养与实时荧光定量PCR阳性检出率对比
检测方法 | 流感样本 | 阳性的例数 | 占比 |
细胞培养 | 2605 | 113 | 4.34% |
实时荧光定量PCR | 2605 | 707 | 27.14% |
X2 | - | | 19.589 |
P | - | | <0.05 |
2.2观察流感阳性样本与阴性样本分离率
经过实时荧光定量PCR阳性检出结果,其中707例流感阳性样本中分离获得113株病毒,占比15.98%(113/707);1898例流感阴性样本中未分离获得病毒株,占比0%(0/1898)。其中流感阳性样本与阴性样本分离率差异显著(X2=17.376,p<0.05)。
2.3观察实时荧光定量PCR检测价值
根据细胞培养结果,实时荧光定量PCR特异性100.00%(1898/1898),详情见表2。
表2 实时荧光定量PCR检测价值分析
细胞培养 | 实时荧光定量PCR | 总计 | |
阳性 | 阴性 | ||
阳性 | 113 | 0 | 113 |
阴性 | 594 | 1898 | 2492 |
总计 | 707 | 1898 | 2605 |
3.讨论
流感病毒具有较短的潜伏期以及极强的感染性特点,是一种普遍可见的RNA病毒,感染期间有可能会变异,一旦疏忽,便会暴发,威胁到社会安全[3]。因此,有必要及时检测,及时高效控制流感病毒传播。单独进行胶体金快速检测方法,灵敏度偏低,临床应用受限。目前临床对于流感病毒检测过程中,虽然细胞培养比较可靠,但操作耗时长,过程复杂,不能满足应急检测需求,使其无法在基层医疗单位广泛普及[4]。实施荧光定量PCR具有较高的特异性,能够对流感病毒进行自动化检测,以免样本污染。本研究对照观察,结果细胞培养阳性检出率4.34%明显低于实时荧光定量PCR阳性检出率27.14%(p<0.05)。分析流感样本分离率,结果实时荧光定量PCR法获得的流感阴性样本分离率0.00%明显低于阳性样本分离率15.98%(p<0.05)。根据细胞培养结果,实时荧光定量PCR特异性100.00%。充分肯定了实时荧光定量PCR检测价值。在反应体系之中,加入淬灭基团、荧光报告基团,反应时便会逐步升高扩增产物,产生大量的荧光信号,方便检验人员观察分析,根据荧光信号强度变化,明确PCR实施进程,与此同时,构建标准曲线,深入的定量分析[5]。PCR反应过程包括荧光背景信号、信号扩增、平台期等三个阶段,第一阶段中会出现少量的荧光信号,极易被覆盖,影响检验人员观察;平台期的信号扩增情况比较稳定,变化不明显[6]。信号扩增反应阶段,DNA模板直接关系着扩增产量。
总而言之,实时荧光定量PCR检测方法耗时短、操作简单、特异度高,值得现代临床将之作为流感病毒检测的首选方法。
【参考文献】
[1]李楠,李婕,李亚红,等.实时荧光定量PCR法检测肾移植术后BK病毒和JC病毒感染及临床意义[J].黑龙江医学,2019,43(11):1287-1289.
[2]卓丽,兰芸,李粤平,等.实时荧光定量PCR法对肝衰竭合并侵袭性肺曲霉菌病患者的诊断价值[J].实用医学杂志,2019,35(18):2946-2949.
[3]张艳奇.实时荧光定量PCR法在乙肝病毒DNA及血清标志物检测中的应用价值[J].黑龙江医药,2019,32(01):204-205.
[4]薛京昌,卞琛,徐晓怡.实时荧光定量PCR法在流感病毒暴发疫情病原学检测诊断中的应用[J].实用预防医学,2017,24(05):625-626.
[5]杜锴.实时荧光定量PCR法检测乙肝病毒DNA的价值分析与研究[J].中国现代药物应用,2017,11(01):55-57.
[6]韩毅,孙燕萍,周虹,等.实时荧光定量PCR法与分离培养法检测食品从业人员沙门菌和志贺菌的比较研究[J].中国食品卫生杂志,2015,27(02):132-135.
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