简介：摘要目的探索晚期膀胱癌发展过程中与差预后相关的RNA，构建一个长链非编码RNA-微小RNA-mRNA(lncRNA-miRNA-mRNA)网络并加以实验验证，以研究其在晚期膀胱癌发展中的分子调控作用。方法收集肿瘤基因组图谱(TCGA)和NCBI-GEO数据库431例和492例膀胱癌患者组织样本，Ⅲ、Ⅳ期、高级别、高级别≥病理亚分期2期(pT2期)为晚期膀胱癌，Ⅱ、Ⅰ期、低级别为早期膀胱癌；进行差异表达分析、权重基因共表达网络分析、功能富集分析、生存分析、miRNA靶向预测和Pearson相关分析。利用可视化软件构建网络。统计学方法使用t检验、Fisher精确检验、Pearson相关分析、Log-Rank检验比较组间差异，BH法计算错误发现率校正P值，以FDR<0.05、P<0.05为差异统计学意义。随后，收集22例膀胱癌患者组织样本，高级别肌层浸润性≥T2期、高级别或浸润性TaT1期为晚期膀胱癌，低级别非浸润性TaT1为早期膀胱癌；进行实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)、免疫印迹法和免疫组织化学实验。组间比较采用t检验。结果获得相似表达模式的8个长链非编码RNA、28个mRNA和8个微小RNA，并以此构建出核心lncRNA-miRNA-mRNA调控网络，该网络与晚期膀胱癌的侵袭、进展、转移及差预后相关。晚期膀胱癌组织Ⅵ型胶原α1(COL6A1)、Ⅱ型钙粘附蛋白(CDH11)、金属蛋白酶和血小板反应蛋白模体Ⅰ型(ADAMTS12)、长链非编码RNA-01705(LINC01705)、长链非编码RNA-01929(LINC01929 RNA)相对内参表达倍数值高于早期膀胱癌组织(-1.213比-4.212，t＝4.170，P<0.01；-10.75比-14.64，t＝4.602，P<0.01；-7.594比-11.93，t＝5.152，P<0.01；-10.18比16.55，t＝4.493，P<0.01；-11.62比-15.08，t＝2.869，P<0.05)，差异均有统计学意义。晚期膀胱癌组织COL6A1、CDH11、ADAMTS12蛋白平均吸光度值高于早期膀胱癌组织(0.213 8比0.090 9，t＝2.302，P<0.05；0.183 9比0.078 9，t＝5.992，P<0.01；0.279 1比0.147 8，t＝4.527，P<0.01)，差异均有统计学意义。膀胱癌组织人-微小RNA-6875-5p(hsa-miR-6875-5p)、人-微小RNA-6784-5p(hsa-miR-6784-5p)、人-微小RNA-128-2(hsa-miR-128-2) RNA相对内参表达倍数值低于正常组织(-15.78比-12.41，t＝4.995，P<0.01；-15.53比-12.68，t＝3.226，P<0.05；-13.79比-11.43，t＝3.400，P<0.01)，差异均有统计学意义。膀胱癌细胞系T24中COL6A1蛋白相对内参灰度比值低于正常膀胱上皮细胞系SV-HUV-1(0.677比1.000，t＝7.584，P<0.01)，差异有统计学意义；膀胱癌细胞系T24、EJ CDH11蛋白相对内参灰度比值低于正常膀胱上皮细胞系SV-HUV-1(0.656比1.000，t＝6.056，P<0.01)，差异有统计学意义。结论LncRNA-miRNA-mRNA网络在晚期膀胱癌的发展中起关键作用。

简介：摘要目的通过生物信息学方法研究去势抵抗性前列腺癌发展成为神经内分泌性前列腺癌的关键基因。方法从cBioPortal数据库下载前列腺癌的转录本测序数据，使用R语言和加权基因共表达网络分析(WGCNA)软件包进行数据分析，明确癌症类型相关性最高的基因集。对该基因集进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析，明确该群基因和细胞周期及细胞分裂的相关性。再利用STRING数据库计算该基因集内基因的相关性，导入Cytoscape软件中构建基因网络，并计算出处于网络核心的前10个基因。然后在GSE105416数据集中验证这10个基因的表达。最后选择关键基因UBE2C和NUF2做GSEA分析。结果鉴定了10个在前列腺癌神经内分泌转化中的关键基因，分别是BUB1、CDCA8、CENPF、HJURP、KIF23、KIF2C、NUF2、PTTG1、TPX2和UBE2C。结论本研究对前列腺癌的神经内分泌转化提供了新视角，鉴定出关键基因可作用于影响前列腺癌细胞的细胞周期和AR信号通路来影响其神经内分泌转化。

简介：摘要目的探讨长链非编码RNA 565686(lncRNA-565686)对前列腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响及其分子机制。方法收集武汉大学人民医院2017年1月至2020年1月行前列腺癌根治术的33例前列腺癌组织和同期行经尿道前列腺电切术的45例良性前列腺增生组织标本，采用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)技术检测lncRNA-565686在前列腺组织和前列腺癌细胞的相对表达水平。在前列腺癌细胞(PC-3)中转染lncRNA-565686短发卡RNA，分别将未转染短发卡RNA、转染空载体和转染短发卡RNA细胞分为未转染组、空载体转染组和转染组。分别采用细胞克隆增殖实验检测细胞增殖能力；采用细胞迁移和侵袭实验(Transwell实验)检测细胞迁移和侵袭能力；采用双荧光素酶报告基因实验验证lncRNA-565686与微小RNA-195(miR-195)的靶向调控关系。组间比较采用t检验。结果前列腺癌组织中lncRNA-565686的相对表达水平高于良性前列腺增生组织，差异有统计学意义(2.51±0.19比0.99±0.13，t＝39.826，P<0.05)；前列腺癌淋巴结细胞(LNCaP)、PC-3细胞中lncRNA-565686表达水平高于人正常前列腺上皮细胞(RWPE-1)细胞，差异有统计学意义(2.36±0.04和3.58±0.06比0.99±0.06，t＝40.257、68.757，P<0.05)；干扰lncRNA-565686表达后，转染组细胞增殖、迁移和侵袭能力均低于未转染组和空载体转染组。双荧光素酶报告基因实验证实lncRNA-565686与miR-195之间的直接调控关系。结论lncRNA-565686在前列腺癌中高表达，下调lncRNA-565686的表达可明显抑制前列腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力，其机制可能与直接负向调控miR-195的表达相关。