简介：摘要目的比较侵袭性牙周炎（aggressive periodontitis，AgP）、慢性牙周炎（chronic periodontitis，CP）与牙周健康者（periodontally healthy，PH）龈下菌群的差异，为牙周病的病因学研究及基于菌群调控的牙周病新疗法提供参考。方法按纳入标准收集2013年12月至2014年12月在南京大学医学院附属口腔医院·南京市口腔医院牙周病科门诊就诊的AgP（AgP组）、CP（CP组）患者和PH受试者（PH组）各10例，根据X线片和口内情况初步预估取样位点后，收集各组龈下菌斑并记录各项牙周临床指数，提取龈下菌斑样本中的DNA，PCR扩增、构建DNA文库并对16S rDNA测序。最终可成功构建文库并测序者包含：8例AgP患者的18个样本，10例CP患者的31个样本和8名PH志愿者的10个样本。对各组样本的α多样性和β多样性以及菌群构成进行分析和比较，并采用Pearson相关性分析评价细菌与探诊深度的相关性。结果菌群分析显示，AgP组龈下菌群的α多样性显著低于其他两组（P<0.05）。在门水平，AgP和CP组拟杆菌门丰度[分别为（36.8±7.4）%、（37.2±6.3）%]、螺旋体门丰度[分别为（16.0±5.4）%、（11.8±3.6）%]均显著高于PH组[分别为（27.5±11.2）%、（5.2±4.4）%]（P<0.05），而放线菌门和变形菌门丰度[AgP组分别为（4.2±3.3）%、（12.9±5.1）%；CP组分别为（6.1±2.6）%、（12.1±4.0）%]均显著低于PH组[分别为（19.3±13.1）%、（23.0±10.1）%]（P<0.01）；AgP组龈下菌群中螺旋体门和柔壁菌门的丰度[分别为（16.0±5.4）%、（1.7±1.2）%]均显著高于CP组[分别为（11.8±3.6）%、（0.7±0.6）%]（P<0.05）。在属水平，AgP组龈下菌群中棒状杆菌属、放线菌属、Saccharibacteria_norank、月形单胞菌属、Oribacterium的丰度显著低于CP组，而产线菌属、Lentimicrobiaceae_norank、Defluviitaleaceae_UCG_011、Family_XI_unclassified的丰度显著高于CP组(P<0.05）。主坐标分析显示，各组样本存在聚类现象。线性判别分析显示，AgP组富集菌包括螺旋体科等，CP组富集菌包括拟杆菌科等。相关性分析显示，AgP组中密螺旋体属、Defluviitaleaceae_UCG_011、支原体属、卡氏菌属、Fretibacterium的丰度与探诊深度呈显著正相关（r=0.525~0.750，P<0.05），丛毛单胞菌科-未分类的属、链球菌属、二氧化碳噬纤维菌属、奈瑟菌属、普雷沃菌属、消化球菌属、劳尔菌属、Bergeyella和放线菌属的丰度与探诊深度呈显著负相关（r=-0.617~-0.490，P<0.05）；CP组小类杆菌属、Family_XI_unclassified、卡氏菌属、消化链球菌属、Pelospora和理研菌科_RC9_肠组的丰度与探诊深度呈显著正相关（r=0.430~0.533，P<0.05）。结论牙周炎症和健康时其龈下菌群存在明显不同；AgP和CP的龈下菌群也存在明显差异，提示这可能是两种不同的疾病。

简介：摘要目的观察抗菌多肽联合甲硝唑治疗慢性牙周炎的临床效果及对其龈下主要菌群的影响。方法抽取2019年10月至2021年11月忻州市第二人民医院口腔科收治的慢性牙周炎患者60例，按照随机数字表法分为观察组与对照组，每组30例。对照组给予甲硝唑治疗，观察组在对照组治疗基础上给予抗菌多肽联合治疗。比较两组治疗效果、牙周状态(牙周袋深度、菌斑指数及牙龈指数)、龈下主要菌群占比及治疗后不良反应发生情况。结果观察组总有效率(96.67%，29/30)高于对照组(76.67%，23/30)，P<0.05。治疗后，观察组牙周袋深度、菌斑指数及牙龈指数均小于对照组(P均<0.05)。治疗后，观察组牙龈卟啉单胞菌、伴放线放线杆菌在牙周细菌总量中的占比[(0.15±0.02)%、(0.011±0.002)%]均低于对照组[(0.20±0.03)%、(0.014±0.002)%]，P均<0.05。治疗后，观察组不良反应发生率(16.67%，5/30)与对照组(10.00%，3/30)比较差异未见统计学意义(P>0.05)。结论抗菌多肽联合甲硝唑治疗慢性牙周炎的效果较好，患者经治疗后牙周状态改善，龈下主要致病菌群占比降低，且联合用药安全性较高。

简介：摘要目的探究上消化道肿瘤内细菌群落特征。方法研究人群为上消化道肿瘤患者(食道癌、胃癌)。对入组患者进行胃镜检查(n＝17)并在肿瘤部位进行取材，同时取距离肿瘤组织4 cm以上远端的非肿瘤组织作为对照。对样本总DNA进行提取纯化后进行高通量16S DNA基因测序，应用生物信息学分析肿瘤组织内特有的细菌群落特征及与非肿瘤组织相比细菌群落水平上的差异。结果16S DNA PCR结果显示肿瘤内的细菌负荷没有发生明显变化。α和β多样性的比较结果显示，两组的细菌群落组成相似度较高，组内各样本较为离散，菌落构成差异性较大，但整体上两组差异无统计学意义。维恩图展示出肿瘤组织1 358个OTU (operational taxonomic unit)，非肿瘤组织2 068个OTU，表明肿瘤组织的细菌群落物种丰富度降低。群落组成分析发现普雷沃菌科(属)、乳杆菌科(属)、梭杆菌科(属)在肿瘤组织中富集(丰度平均百分比均超过非肿瘤组织的1倍以上)。进一步对两组样本菌科和菌属丰度前十的细菌进行配对比较显示，假单胞菌在科(P＝0.041)和属(P＝0.041)水平上均显示在肿瘤组织中明显减少，而普雷沃菌在科(P＝0.031)和属(P＝0.007)水平上在肿瘤组织中均显著富集。结论上消化道肿瘤微环境的细菌群落发生改变，富集在肿瘤部位的物种主要为口腔常见的厌氧菌如普雷沃菌科(属)、乳杆菌科(属)、梭杆菌科(属)，其中以普雷沃菌科(属)最为显著。

简介：摘要婴儿期是肠道菌群形成和发展的关键时期，其肠道菌群主要来源于母体与其之间的菌群交换。剖宫产、早期接触抗生素和配方奶喂养可能会破坏微生物群的建立，并对健康产生不利影响。母乳寡糖(HMOs)是一类结构多样的非共轭聚糖，母乳中含量丰富，可调节婴儿肠道菌群组成，对婴儿肠道健康产生有益影响。为了解婴儿肠道菌群的定植特点及HMOs对肠道菌群的影响，现就此综述如下。

简介：摘要齿垢密螺旋体是与牙周病发生发展密切相关的一类革兰阴性厌氧微生物，在成熟牙菌斑中占比较高。作为龈下菌斑生物膜的晚期定植者，齿垢密螺旋体与更早期的定植者及同期定植者之间存在复杂的相互作用关系，这些相互作用包括共生关系，以及群体感应分子调控下的协同与拮抗作用。黏附与共聚是这些相互作用的基础，由一系列表面分子介导。这种相互作用最终表现为代谢、毒力方面的基因表达改变，以代谢改变为主，涉及多种氨基酸代谢相关酶的上调或下调。本文就齿垢密螺旋体与龈下菌斑微生物相互作用的相关研究作一综述。

简介：摘要肠道菌群与宿主免疫反应之间存在直接和间接的相互作用，能够对宿主健康产生多方面的影响。肠道菌群紊乱导致的生态失调与许多疾病的易感性有关，特别是免疫相关性疾病。本文根据近年来的研究结果，介绍了肠道菌群与宿主免疫相互作用的机制，阐述了肠道菌群在免疫相关性疾病发生发展中的作用，包括炎性肠病等肠道系统疾病以及类风湿关节炎等其他系统疾病，并总结了以肠道菌群为靶点的疾病治疗策略。更好地了解肠道菌群与免疫相关性疾病的研究进展，将有助于此类疾病的预防和管理工作，并拓宽我们发现疾病干预靶点的路径。

简介：摘要双相情感障碍是慢性严重精神疾病，但其发病机制仍然不明，易复发，治愈率不理想。而肠道菌群在维持人体健康和调节人体功能等方面有着重要的作用，人体内肠道菌群的改变可以直接或间接导致多种疾病的发生。并且越来越多的研究发现，多种精神类疾病的患者和部分躯体疾病的患者其肠道菌群有着明显的改变，因此，脑-肠-菌群轴的深入研究成为探索精神疾病客观标志物及发病机制的一个热点方向。文章就近年来肠道菌群与双相情感障碍关系的研究进展作一综述，从脑-肠-菌群轴、双相障碍的肠道菌群改变、肠道菌群引起双相障碍的可能生物机制以及双相障碍的治疗新发现几个方面进行阐述，为临床双相障碍生物标志物的进一步研究以及有效诊疗提供参考。

简介：摘要菌群移植（FMT）作为一种革新疗法，为复发性难辨梭菌感染（CDI）的治疗取得突破性的进展。随着生物技术快速的发展，肠道菌群与疾病的联系逐渐得到揭示，FMT在其他传统治疗效果不佳的肠道内外疾病的应用前景也被给予了厚望。但FMT作为新的疗法还存在诸多的未知领域，包括临床供体的筛选、标准化菌液和胶囊的制备、适应证的把握、供体受体的匹配和并发症的防治等，均还在探索阶段。本中心自2012年探索性地开展FMT的治疗，已经治疗逾3 500余例病例，共移植60 000余次。基于大样本的数据和经验，本期对这些问题进行了专刊报道和讨论，并重点推出中国FMT标准化方法学的建立与临床应用，对我国FMT治疗的健康发展定会起到积极的推动作用。

简介：摘要肠道菌群是一个庞大且复杂的微生物群落，位于人体胃肠道生态系统中，作为人体内一个隐藏的内分泌器官，肠道菌群失调不仅影响各种肠道疾病，还会导致代谢异常的发生，例如糖尿病、肥胖、代谢综合征等。越来越多的研究表明，肠道菌群与内分泌疾病的发生、发展息息相关，其中肠道菌群与糖尿病的研究最多，被广泛关注，而对于其他内分泌疾病与肠道菌群的相关性还认识不足。从内分泌各腺体角度总结和讨论当前的发现，以阐明肠道菌群在内分泌疾病发展中的作用及潜在的机制，可能会为疾病的治疗策略提供新的见解。

简介：摘要目的分析铜绿假单胞菌肺炎患者的细菌耐药性及下呼吸道菌群的变化情况。方法选取2016年1月至2018年12月大同市第三人民医院呼吸与危重症医学科收治的96例医院感染铜绿假单胞菌肺炎患者，男62例，女34例，年龄(59.43±13.66)岁，年龄范围为31～74岁。对铜绿假单细胞菌所导致的医院感染铜绿假单胞菌进行耐药性的检测，并对其下呼吸道菌群的变化情况进行分析。结果医院感染铜绿假单胞菌肺炎的临床科室分布为神经外科32例，神经内科18例，呼吸内科26例，外科ICU 11例，其他科9例。铜绿假单胞菌具有较强的耐药性，从弱到强依耐受的药物顺序为舒巴坦<头孢吡肟<环丙沙星<美罗培南<他唑巴坦<头孢他啶<阿米卡星<左氧氟沙星<亚胺培南，差异有统计学意义(P<0.001)。96例患者标本中共分离培养出143株细菌，其中革兰阴性杆菌共96株(铜绿假单胞菌72株、鲍氏不动杆菌10株、肺炎克雷伯菌8株、大肠埃希菌6株)；革兰阳性球菌株47例(肺炎链球菌25株、金黄色葡萄球菌13株、溶血性链球菌9株)。采用头孢哌酮钠舒巴坦钠＋左氧氟沙星治疗结束时，患者行下呼吸道分泌物培养，革兰阴性杆菌培养阴性44株，菌群变化10株；革兰阴性杆菌培养阴性10株，菌群变化9株。结论铜绿假单胞菌肺炎患者对亚胺培南的耐药性最高，对舒巴坦耐药性最低，下呼吸道感染病原菌主要为革兰阴性杆菌。及时监测铜绿假单胞菌及其他菌群的变化，有助于临床医生合理安全的使用抗菌药物。

简介：摘要目的研究正常孕妇阴道菌群特征及影响因素。方法本研究基于2018年2月至2020年2月在安徽医科大学附属安庆医院建立的孕妇队列，将所有符合纳入排除标准的"正常"孕妇阴道样本，按采样孕周顺序排列，以每个孕周为一抽样层，每层随机抽取5例样本，不足5例则全部纳入，使用16S rRNA基因测序技术测得样本V3~V4序列。利用MicrobiomeAnalyst进行优势菌种分析。Alpha多样性以Chao1、Observed Features、Shannon、Simpson、Faith_pd、Pielou′s Evenness指数的对数值进行表示，并依据样本是否以乳酸菌为主导划分为两类，分别利用多重线性回归、Logistic回归探索影响因素。连续性变量采用方差分析、Kruskal Wallis检验，分类数据则采用卡方检验、Fisher检验。P<0.05时认为数据差异有统计学意义。结果本研究纳入91例孕妇/91例阴道标本，平均年龄为(27.37±3.60)岁，孕早期、孕中期、孕晚期分别纳入18个、56个和17个阴道样本，孕周中位数分别为11.93周、19.43周和38.29周。样本物种组成：门水平上，厚壁菌门相对丰度为91.30%；属水平上，乳酸菌属相对丰度为87.67%；种水平上，惰性乳酸菌、卷曲乳酸菌相对丰度分别为42.95%、36.33%。惰性乳酸菌在所有孕期均显示出优势性，其相对丰度较高的样本数随孕期逐渐减少，卷曲乳酸菌在孕中期、孕晚期显示出优势性，其相对丰度较高的样本数随孕期逐渐增加。孕期阴道菌群Alpha多样性随着孕周推进，呈逐渐降低的趋势。不同吸烟习惯孕妇阴道菌群Pielou′s Evenness多样性指标差异有统计学意义(P<0.05)，不同饮酒习惯孕妇阴道菌群Shannon多样性指标差异具有统计学意义(P<0.05)。不同教育水平孕妇阴道菌群Chao1、Observed Features、Faith_pd多样性指标差异有统计学意义(P<0.05)，不同收入水平孕妇阴道菌群Shannon、Simpson多样性指标差异有统计学意义(P<0.05)。结论正常孕妇阴道内以乳酸菌为主导，随着孕期推进，惰性乳酸菌的优势性逐渐降低，卷曲乳酸菌优势性逐渐升高。正常孕妇阴道菌群Alpha多样性与吸烟、饮酒、教育水平、家庭收入水平有关，孕前戒烟、孕前有饮酒习惯的孕妇阴道菌群Alpha多样性较低，较低教育水平、较高家庭收入水平孕妇阴道菌群Alpha多样性较高。

简介：摘要血管性认知损害（vascular cognitive impairment, VCI）是仅次于阿尔茨海默病的第2常见痴呆类型。作为中枢神经系统与胃肠道之间的通路，脑肠轴已成为众多疾病发病机制的研究热点之一。肠道菌群失调可能介导或影响动脉粥样硬化、高血压、代谢性疾病和缺血性卒中等血管危险因素，最终加速VCI的发生和发展。文章对肠道菌群与VCI及其主要危险因素的相关文献进行了综述，以期为VCI的预防和治疗提供新思路。

简介：摘要肺移植是终末期肺痰病患者唯一有效的治疗手段，但肺移植受者的长期存活率仍较低。随着细菌16s核糖体小亚基RNA(rRNA)基因测序、高通量测序技术的发展，呼吸道样本中微生物的相对丰度得以量化，潜在病原体和共生环境也得以识别，揭示了健康肺部存在丰富的菌群。越来越多的证据表明，肺部菌群不仅可以调节肺部免疫稳态，而且在多种呼吸系统疾病的发生与发展中起重要作用。肺移植受者的肺部菌群有异于健康人群，并与其术后并发症及预后相关。本文对近年来国际上关于肺移植受者的肺部菌群特点及其与肺部感染、慢性排斥反应的关系进行综述，以期为肺移植术后并发症的发生与诊治提供新的思路。

简介：摘要脑肠轴是中枢神经系统与胃肠道间相互作用的重要通路。缺血性卒中可促进肠道菌群失调和移位，肠道菌群及其代谢产物也会反向影响缺血性卒中的发生、发展及转归。文章对缺血性卒中与肠道菌群的相关文献进行回顾，以综述两者的联系及相关机制，并对靶向肠道菌群的卒中治疗进行了展望。

简介：摘要脊髓损伤严重影响患者胃肠功能并引发肠道菌群失衡，导致脊髓神经炎症加剧。近年来，随着“肠道菌群-肠-脑”轴理论的提出，肠道菌群在中枢神经与胃肠系统中的调节作用逐渐得到重视。尽管已有相当多的研究从不同角度关注脊髓损伤患者肠道菌群特征对脊髓神经功能修复的影响，但当前以肠道菌群为干预靶点治疗脊髓损伤的研究模式繁多，仍缺乏统一有效的临床治疗方法。笔者就脊髓损伤患者肠道菌群特征及以肠道菌群为靶点的治疗方法研究进展进行综述，为脊髓损伤的临床救治与基础研究提供参考。

简介：摘要结直肠癌(colorectal cancer，CRC)是一种发生在人体下消化道结肠或直肠的恶性肿瘤。世界范围内，其在各种癌症中的发病率和死亡率分别居于第三和第二位，严重威胁人类的健康。近来的数据表明，肥胖、饮食和运动会影响CRC的发病率。而这些因素对CRC的影响很大程度上依赖于肠道菌群的代谢活动。肠道致病菌可以通过其表面蛋白定殖于结直肠组织，并通过其毒力蛋白与宿主细胞受体结合使肠道微环境发生变化，进而促进结直肠癌的发展。目前，已经有大量的研究表明核梭杆菌(Fusobacterium nucleatum，F.n)、产肠毒脆弱拟杆菌(Enterotoxigenic Bacteroides fragilis，ETBF)和大肠杆菌(Escherichia coli，E.coli)是结直肠癌相关的重要致病菌。本文就F.n、ETBF和E.coli的毒力蛋白及代谢物，在CRC发展中的作用机制，以及益生菌柔嫩梭菌群对CRC的影响等作一简要综述。

简介：摘要阿尔茨海默病（Alzheimer′s disease，AD）的病因不明，越来越多的研究表明肠道菌群与AD 的发生发展密切相关。肠道菌群通过脑-肠轴影响中枢神经系统，在AD患者认知功能、精神行为症状的发生发展中有重要的作用；另外，肠道菌群与AD临床标志物存在密切关联，通过改善AD患者肠道菌群也可以改善认知功能。因此，针对肠道菌群领域的研究为AD的防治尤其是早期诊断提供了新的研究思路。

简介：摘要肠道菌群-肠-脑轴在神经、精神发育和胃肠道疾病的生物和生理学基础研究领域中越来越受关注。肠道菌群和大脑通过自主神经系统、免疫系统、代谢产物(如短链脂肪酸、胆汁酸和支链氨基酸)等多种途径相互交流。影响宿主菌群组成的因素众多，包括遗传、分娩方式、感染、抗生素的使用、营养状况、环境压力源、生活习惯和昼夜节律等。焦虑症、抑郁症、肠易激综合征、炎症性肠病、肥胖、孤独症等多种疾病涉及肠道菌群-肠-脑轴改变，动物模型、粪菌移植、脑成像和菌群基因组测定等研究方式的发展对了解肠道菌群-肠-脑轴起到了至关重要的作用。

简介：摘要目的探讨宫内缺氧对新生大鼠肠道菌群的影响。方法构建大鼠宫内缺氧模型，采集生后首日及第7日宫内缺氧及正常新生大鼠肠道内容物，分为对照1 d组、对照7 d组、宫内缺氧1 d组、宫内缺氧7 d组，应用高通量测序技术对4组样本进行16S rRNA基因测序，对测序结果进行生物信息分析，比较组间菌群多样性、丰富度及组成结构的差异。结果（1）宫内缺氧1 d组肠道菌群Alpha多样性高于对照1 d组，代表菌群丰富度的sobs指数（114.5±35.6比50.5±21.3）、chao指数（135.6±38.5比73.9±28.8）大于对照1 d组，差异有统计学意义（P<0.05）；宫内缺氧7 d组sobs、ace、chao、simpson指数低于对照7 d组，shannon指数高于对照7 d组，但差异均无统计学意义（P>0.05）。（2）门和属水平上，宫内缺氧1 d组优势菌群分别为厚壁菌门和链球菌属，对照1 d组分别为变形菌门和埃希志贺氏菌属。宫内缺氧7 d组与对照7 d组之间肠道菌群的差异较首日两组之间的差异有所减小；与宫内缺氧1 d组相比，宫内缺氧7 d组埃希志贺氏菌属占比增加，链球菌属占比降低。结论宫内缺氧改变了新生大鼠肠道菌群的初始定植，影响了新生大鼠肠道菌群的丰富度及结构组成。

简介：摘要大量共生菌群定居于肠道中，在维持肠道正常功能、调节机体免疫和代谢等多种生命活动中发挥重要作用。近年来研究发现肠道菌群参与多种肠外疾病的发生及发展。在眼科领域，葡萄膜炎、年龄相关性黄斑变性、青光眼等疾病也受肠道菌群的影响。不同因素作用下，肠道菌群及其代谢产物改变机体免疫稳态或调控多种代谢途径，诱导眼部自身免疫性反应、促进慢性炎性反应状态。本文就肠道菌群与眼科疾病的关系进行综述，以期为多种眼科疾病的发病机制及干预措施提供新的研究思路。