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  • 简介:普通洋葱(AlliumcepaL.)是一种开放授粉重要蔬菜作物,在洋葱品种纯度鉴定因其亲本保有一定程度异质性,所以杂交种纯度百分率难以确定。为了有效地控制杂交种纯度质量,本研究从收集于各文献89对引物筛选出了12对具有多态性引物,利用筛选出12对SSR引物对39份洋葱种质进行分析,检测到47条多态性带,平均有效等位基因数为7.25。可变类平均法(Flexiblegrouplinkage)聚类分析表明,SSR标记可将39份洋葱划分为三大类,聚类分析结果与洋葱自然属性是相符合。同时发现这些标记在常规品种、亲本自交系内,甚至在杂种一代中都显示出很高遗传异质性。为了促进和提升繁育品种质量鉴定准确性,本研究所提出SSR分子标记辅助育种方案,可通过选定SSR位点纯和原种田,制出杂交种。该方案能在选育几个SSR位点检测出准确杂交率,还可以有效地监测洋葱F1代杂交种纯度质量,并且这个方案可以用于任何表现出严重近交衰退异花授粉作物SSR标记分子纯度鉴定,为促进和提升繁育品种质量鉴定准确性提供帮助。

  • 标签: 洋葱 SSR标记 遗传多样性 种内异质性 纯度鉴定
  • 简介:WRKY转录因子是高等植物中最重要转录因子基因家族之一,在植物应对生物胁迫(病原菌和病毒等)和非生物胁迫(干旱,盐害,冷害和热害等)等一系列逆境应答进程中发挥重要作用。目前高等植物WRKY转录因子在调控植物应答生物胁迫和非生物胁迫相关功能进行了总结。在目前已经报道WRKY转录因子功能基础上,分析了不同植物WRKY转录因子逆境应答模式和功能特征,为未来探索作物WRKY转录因子逆境应答调控机理奠定基础。

  • 标签: 植物 WRKY转录因子 胁迫应答 功能
  • 简介:松树是世界上分布最广且最具经济价值树种之一。近年来随着DNA分子标记技术发展,分子标记已经广泛应用于松树遗传多样性、亲缘关系、遗传图谱构建、基因定位及分子标记辅助选择等方向。本文从遗传多样性、亲缘关系、遗传图谱构建、基因定位及标记辅助选择等角度,评述了松树遗传与进化上常用DNA分子标记如RFLP、RAPD、AFLP和SSR等应用情况和进展。在遗传多样性方面,DNA分子标记技术已成为鉴定松树种间、种内遗传多样性有效手段,并用于指导杂交育种;在亲缘关系判定方面,可以在分子水平上阐明生物系统演化及分类情况,揭示育种亲本选配和种质资源有效利用;在松树遗传图谱构建和基因定位及标记辅助选择方面也取得了显著进展,构建了二十多张连锁图谱,并对其生长、材性和抗性等性状进行了基因定位,获得了一些重要与抗病相连锁标记。

  • 标签: 松树 分子标记 遗传 进化
  • 简介:寄主诱导基因沉默(hostinducedgenesilencing,HIGS)技术是基于RNAi而发展起来新技术,它既可以从反向遗传学方向鉴定植物病原真菌基因功能,又可以通过在寄主植物中表达沉默病原物特定基因HIGS载体,以达到控制病原菌扩展,提高作物抗病性目的。因此HIGS在研究植物病原真菌致病机理和作物抗病育种中极具应用前景。HIGS技术从报道以来在植物保护领域得到了广泛运用,其适用范围广,可以在多种病原真菌中进行应用,特别对于难培养和难以进行遗传转化真菌。并可以在植物抗病育种中发挥更大空间,为病害防治提供可靠策略。本综述总结概括了HIGS技术原理和它在植物病原丝状真菌研究最新进展,为该技术在更多植物病原真菌使用提供参考依据。

  • 标签: 寄主诱导基因沉默 丝状真菌 致病基因 抗病育种
  • 简介:水淹胁迫是植物遭受主要非生物胁迫之一,对作物生长发育、产量、品质等都会带来严重影响,全面解析植物耐涝机制,对选育耐涝品种具有重要意义。高通量转录组测序技术以其数字化信息、高灵敏度、广泛检测范围及重复性好等优点,已被广泛用于生物体多种功能研究。目前在水稻、玉米、油菜、黄瓜、大豆等多个物种,已有从转录水平分析植物对水淹胁迫分子响应机制相关研究报道,这对于深度解析植物耐涝分子响应机制和加快作物耐涝品种选育具有重要意义。但目前尚未有转录组测序技术在植物水淹胁迫应用方面的综述。因此,本研究着重综述了植物水淹胁迫测序组织及时间点选择、各阶段基因表达水平、GO功能富集、小RNA功能特征几个方面,并展望了新一代测序技术在植物抗逆机理研究应用前景。

  • 标签: 植物水淹胁迫 转录组测序 差异表达基因 GO功能富集
  • 简介:用DNA分子标记技术,对21份番茄种苗进行黄化曲叶病毒病(TYLCV,TY)抗病基因及病毒病感染检测。结果表明:9份材料携带ty-1/ty-1、ty-2/ty-2和Ty-3a/ty-3a抗性基因,1份材料携带ty-2/ty-2和Ty-3a/ty-3a抗性基因;自根苗欧迪斯、嫁接苗金棚/11-8、金棚/荣威和金棚/双飞8号已经感染TY。种苗进行田间种植,其中携带抗性基因番茄品种没有发生TY,抗性较强;在已感染TY4份材料中,欧迪斯田间表现感染TY,其余3份未发生TY。试验表明,TY分子标记技术检测可靠,可以在番茄育苗生产中推广应用。

  • 标签: 番茄 TYLCV 分子标记 抗性基因 检测
  • 简介:转运体是生物体内一类跨膜蛋白,主要参与离子以及一些小分子吸收、转运和隔离。百草枯是一种联吡啶类速效触杀灭生性除草剂,主要作用于光系统Ⅰ光合膜系统,影响电子传递。在正常生理条件下,植物拥有解毒系统,能除去叶绿体活性氧。科学家针对生物对百草枯抗性进行了一系列研究和假说,其常见抗性机制如抑制转运、隔离到液胞、增强氧自由基清除酶活性等。其中,抑制转运和隔离到液胞较为合理。深入研究转运体对百草枯关系,是培育转基因抗百草枯植物重要基础。本文主要综述了转运体在百草枯抗性可能作用。

  • 标签: 转运体 百草枯 除草剂 抗性机制
  • 简介:DNA分子标记为直接从遗传物质进行育种材料选择提供了有效手段,在玉米育种得到广泛应用。随着DNA分子标记技术不断发展,功能标记开发与应用成为一个新发展方向。功能标记与重要农艺性状直接相关,具有育种材料选择直接性和准确性。为了在玉米育种更广泛地应用功能标记辅助选择,本综述简要介绍了功能标记含义和功能标记开发策略。在此基础上,对玉米功能标记开发与应用研究进展进行了综述。

  • 标签: 玉米 DNA分子标记 功能标记
  • 简介:荧光原位杂交技术(fluorescenceinsituhybridization,FISH)在植物研究已被广泛应用,它是20世纪80年代发展起来一种非放射性原位杂交技术,是将特定DNA序列定位在染色体或染色质上一门新兴分子细胞遗传学方法。该技术灵敏度和准确性较高并且安全、直观。本文简单介绍了该技术基本原理,重点从染色体制片、探针标记技术、染色质凝缩程度、与分带技术相结合和单拷贝或低拷贝基因检测等方面,阐述了近些年该技术发展状况,最后本文概述了该技术在基因工程育种应用,并展望其应用前景。

  • 标签: 荧光原位杂交 染色体 基因工程
  • 简介:生物芯片技术自上个世纪90年代诞生以来,在生物科研方面该技术起到了越来越重要作用并且得到了国内外广泛重视。本研究先对生物芯片各个主要分类进行详细介绍,说明相关原理,结合国内外近年来最新科研报道进行总结,根据该技术在测序,基因表达,抗病机理等研究巨大作用,对生物芯片技术在植物分子生物研究不同领域、不同层面、实验技术方法以及研究策略上进行阐述。

  • 标签: 生物芯片 实验技术方法 植物分子生物研究
  • 简介:农杆菌介导遗传转化生物技术已经被广泛应用。蚜传辅助因子(helpercomponent-proteinase,HC-Pro)是一种RNA沉默抑制子,而HC-Pro蛋白对植物基因组DNA甲基化影响及其作用机制并不十分清楚。我们采用农杆菌介导烟草(NicotianabenthamianaL.)叶盘转化法将外源基因HC-Pro转化烟草。并优化了各种侵染条件,包括农杆菌重悬液浓度,选择培养基卡那霉素浓度和生根培养基活性炭比例。此外,我们介绍了一种简单而有效生根技术,即水培生根法,并利用这种技术快速获得了HC-Pro转基因株系。半定量RT-PCR(Reversetranscription-PCR)检测结果表明,HC-Pro在转基因烟草及转基因后代植株稳定表达,为HC-Pro蛋白功能研究提供了实验帮助。

  • 标签: 烟草 叶盘转化法 RNA沉默抑制子 蚜传辅助因子
  • 简介:为了明确黑龙江主栽水稻品种及骨干育种亲本抗稻瘟病基因分布情况和利用价值,本研究对102份水稻资源抗稻瘟病基因Pid2、Pid3、Pi9、Pi2/Pizt、Pita、Pi5及Pib进行了分子检测,并对他们分布情况和抗病效应进行相关性分析。结果表明:在102份水稻资源,Pita和Pi5检出率相对较高,为31.37%和29.41%,其次是Pib、Pi2/Pizt、Pid2和Pid3,检出率分别为18.62%、9.8%、1.96%和1.96%;本研究没有检测到Pi9。同时,我们发现多基因聚合品种较携带单基因或不含抗病基因品种抗性强;其中龙粳41携带抗稻瘟病基因最多(4个),表现为抗病。在被检测基因,Pi2/Pizt、Pita和Pi5对黑龙江水稻稻瘟病抗性贡献都较大,但当Pita和Pi5聚合时对黑龙江省水稻抗瘟性改良最大。本研究为黑龙江省水稻抗稻瘟病基因聚合育种以及抗瘟基因合理利用提供了科学依据。

  • 标签: 黑龙江 水稻资源 抗稻瘟病基因 分子检测
  • 简介:偏分离是一种广泛存在于生物遗传学现象,被认为是一种强有力进化动力。本文从生殖隔离因子、细胞质效应以及环境因素三个方面分析了雄配子体选择可能导致遗传偏分离效应。研究证明,位于细胞核基因组上生殖隔离因子如配子体基因、不育基因等遗传因素导致雄配子体选择是引起遗传偏分离主要原因;而细胞质核互作导致雄性不育产生雄配子选择同样可导致核基因发生遗传偏分离;非遗传因素如环境温度等引起雄配子选择也会导致遗传偏分离现象。

  • 标签: 偏分离 配子体选择 生殖隔离 细胞质效应 环境因素
  • 简介:可溶性糖为木薯块根淀粉合成提供底物和能量,准确测定其含量有助于进一步了解木薯块根淀粉积累过程。本研究以水提法提取木薯块根可溶性糖,采用高效液相色谱-蒸发光散射检测法(HPLCELSD)测定样品果糖、葡萄糖、蔗糖含量。以Waters-NH2色谱柱结合Alltech3300ELSD蒸发光检测器进行糖含量测定,流动相为乙腈/水(70/30,V/V),含0.1%氨水。果糖、葡萄糖和蔗糖分离效果较好,在1-25μg范围内线性关系良好,精密度RSD分别为0.31%、0.22%和1.42%,回收率分别为97.62%、98.03%、96.30%,样品稳定性实验RSD分别为0.88%、0.48%和1.05%。实验结果表明HPLC-ELSD法是分析木薯块根蔗糖、葡萄糖、果糖含量有效技术,可为研究淀粉含量不同木薯品种在糖代谢过程差异奠定基础。

  • 标签: 木薯 HPLC-ELSD 果糖 葡萄糖 蔗糖
  • 简介:据报道,酵母HOPS复合体参与囊泡融合及运输。本研究分别以酿酒酵母HOPS复合体各亚基氨基酸序列,通过BLASTp在稻瘟病菌数据库搜索得到了6个酿酒酵母HOPS复合体各亚基同源蛋白,我们通过生物信息学方法对稻瘟病菌6个HOPS复合体亚基同源蛋白理化特性、蛋白质结构域和进化关系进行了分析。基于稻瘟病菌98-06菌丝阶段和孢子侵染水稻CO39不同阶段转录组测序数据,分别选取稻瘟病菌内吞和外泌途径相关基因,制作了表达模式图。此外,MoYpt7蛋白在其假定下游效应因子ΔMoVps41突变体定位研究表明MoVps41可能影响了液泡融合。

  • 标签: 稻瘟病菌 内吞 外泌 MoYpt7 MoVps41
  • 简介:转录组连接基因组遗传信息与蛋白质组,也是基因功能研究基础和出发点。单分子测序技术是近年逐渐成熟新一代测序技术,也称为第三代测序技术,在转录组学研究方面较前代测序技术具有独到优势,应用前景广阔。在非模式植物功能基因组学研究,全长转录本获得可有力地推进相应基础研究水平,而第三代测序技术为此提供了较好解决方案。本研究就目前技术较为成熟且应用较广泛SMRT等单分子测序技术原理进行了介绍,综述了该技术在非模式植物转录组学研究应用现状,对其应用前景进行了展望。

  • 标签: 单分子测序 全长转录组 SMRT 非模式植物
  • 简介:以黑果枸杞为研究对象,利用RT-PCR方法从黑果枸杞cDNA克隆一个bHLH转录因子-LrJAF13,通过生物信息学分析,发现该基因全长为1890bp,编码624个氨基酸亲水蛋白,其分子式是C3O12H4843N853O978S24,分子量为6.94kD,脂肪指数(Aliphaticindex)为85.45,等电点pI为5.24,亲水性(Grandaverageofhydropathicity)为-0.497,不稳定指数(Instabilityindex)为50.13,推断出该基因编码蛋白位于细胞核,蛋白质三维结构复杂,包含多个α-螺旋和β-折叠结构,与矮牵牛拟南芥bHLH基因编码蛋白序列一致性为88%,进化树分析表明黑果枸杞LrJAF13与矮牵牛bHLH转录因子petunia_JAFl3亲缘关系比较接近。通过上述分析,为解析黑果枸杞果实中高花青素含量分子遗传机理、优异资源筛选和新品种选育提供了理论依据。

  • 标签: 黑果枸杞 BHLH 基因克隆 序列分析
  • 简介:木质素(Lignin)是植物苯丙烷代谢途径重要产物之一,它为植物细胞壁提供了必要强度、疏水性以及对外界恶劣环境抗性。其中肉桂醇脱氢酶(CAD)是木质素合成途径一种关键酶,参与S-木质素、G-木质素和H-木质素合成。本文主要对CAD基因特征、CAD在木质素生物合成作用及酶学分析、CAD基因在木质素合成调控研究状况进行了综述,并且对CAD基因研究方法和在实际生产中应用作出了展望。

  • 标签: 肉桂醇脱氢酶 木质素 生物合成
  • 简介:UXS基因参与植物细胞壁合成过程,在植物生长发育起着重要作用。本研究采用生物信息学方法鉴定了玉米全基因组全部UXS结构基因,对其命名和检测相关属性,并对玉米UXS结构基因家族进行构建进化树和染色体定位。通过对进化树分析可清晰地看出基因相似程度和基因之间亲缘进化关系,染色体定位图分析可看出基因在染色体上位置,为进一步了解UXS结构域基因家族在玉米植株作用及功能分析提供了重要依据。

  • 标签: 玉米 UXS基因 木糖 生物信息学 进化树
  • 简介:蓖麻花序生长发育状态是影响蓖麻单产因素之一,PLC基因调节花粉管极性生长。通过RT-qPCR对Lm型蓖麻花序PLC基因家族表达量进行分析,并利用生物信息学工具对其进行生物信息学分析。结果表明:PLC基因表达量与蓖麻花序轴发育时期相关。蓖麻基因组中共有6个PLC基因,其编码蛋白是一个无跨膜结构域、无信号肽/导肽亲水性蛋白,α-螺旋散布于整个蛋白质,具有PLCXc、PLCYc和C2三个特征结构域。此外,蓖麻PLC2、PLC2M、PLC4、PLC4X2、PLC6蛋白定位在其他细胞器;PLC2N定位在线粒体,预测剪切位点序列长度为23个氨基酸。本研究为进一步研究PLC基因家族对蓖麻花序发育过程影响提供了一定理论依据。

  • 标签: 蓖麻 PLC基因 RT-QPCR 生物信息学分析