简介:比较分析了甲烷八叠球古菌(Methanosarcinamazeistr.Goel)和其他2种系统发育相关的广古细菌(嗜苦古菌(Picrophilustorridusstr.DSM9790)和盐碱古菌(Natronomonaspharaonisstr.DSM2160))的同义密码子使用偏好性.结果表明甲烷八叠球古菌的密码子使用偏好性很小,并且与GC3S值有很高的相关性.这3种广古细菌的密码子使用模式在进化上很保守.通过分层聚类分析,得出较之基因功能对密码子使用的影响,这些广古菌密码子的使用更是由其物种所决定的.考虑到这3个物种生活在pH值差异很大的环境中,推测其生活环境在很大程度上决定了这些微生物密码子的使用方式.