简介:目的通过对miRNA-126*进行靶基因预测及信号通路生物信息学分析,以期为miRNA-126*靶基因相关实验及其调控肺发育机制的深入研究奠定基础。方法首先利用microRNA(miRNA)芯片技术分别检测胎龄16d、19d和21d胎鼠肺组织中miRNA-126*的表达水平,进而应用miRGen2.0数据库通过生物信息学方法预测其可能的靶基因,然后对其靶基因集合应用Cytoscape及其插件BiNGO进行功能富集分析(GO-analysis),最后应用DAVID数据库进行靶基因信号转导通路富集分析(KEGGPathwayanalysis)。结果miRNA-126*表达量在胎龄16d、19d和21d3组胎肺组织间逐渐上升。miRNA-126*预测靶基因共有422个,其靶基因集合功能富集于葡萄糖醛酸转移酶、糖代谢等分子功能,多细胞器官发育、发育进程等生物学过程及细胞分隔、细胞器界膜等细胞组分上。信号转导通路则显著富集于RNA降解信号通路,以及朊蛋白疾病信号通路中。结论本研究结果提示miRNA-126*参与了大鼠胎肺发育过程,为今后研究肺发育提供理论基础。
简介:摘要目的探讨胸腔生物电阻抗法无创血流动力学监测(NHM-BIA)预测新生儿脓毒症(NS)患儿心功能障碍(CD)的价值。方法选择2017年1月至2020年11月,西安交通大学附属儿童医院新生儿重症监护病房(NICU)收治的152例NS患儿为研究对象。采用回顾性研究方法,根据NS患儿是否并发CD,将其分为研究组(n=53,并发CD)与对照组(n=99,未并发CD)。对2组患儿性别、出生胎龄、出生体重、危重新生儿比例,血清N-末端脑利钠肽前体(NT-proBNP)、高敏肌钙蛋白(hs-cTn),肌酸激酶同工酶MB(CK-MB),心房、室内径及射血分数,以及心率、每搏输出量指数(SI)、心排血量(CO)、心指数、每搏输出量变异度(SVV)、校正流动时间(FTC)、外周血管阻力(SVR)、外周血管阻力指数(SVRI)、心肌收缩指数(ICON)、收缩时间比(STR)等NHM-BIA指标采用成组t检验、Mann-Whitney U检验与χ2检验进行统计学比较。对NS患儿并发CD的影响因素进行多因素非条件logistic回归分析。绘制NHM-BIA不同指标预测NS患儿并发CD的受试者工作特征(ROC)曲线,并计算曲线下面积(AUC)。根据约登指数最大原则,确定这些指标预测NS患儿并发CD的最佳临界值。本研究遵循的程序符合本院伦理委员会规定,通过本院伦理委员会审查,并获得批准(审批文号:20210034)。2组NS患儿性别构成比、出生胎龄、出生体重等一般临床资料比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。结果①研究组患儿危重新生儿比例及血清NT-proBNP、hs-cTn水平,均显著高于对照组,并且差异均有统计学意义(P<0.05)。②研究组NS患儿心率、SVV、SVR、SVRI、STR,均显著高于对照组,而SI、心指数、FTC、ICON,均显著低于对照组,并且差异均有统计学意义(P<0.05)。③多因素非条件logistic回归分析结果显示,血清NT-proBNP、hs-cTn水平高,是NS患儿并发CD的独立危险因素(OR=1.001、1.095,95%CI:1.000~1.001、1.047~1.146,P均<0.001),而心指数高是NS患儿并发CD的独立保护因素(OR=0.075,95%CI:0.022~0.253,P<0.001)。④血清NT-proBNP、hs-cTn水平与心指数及3项指标联合预测NS患儿并发CD的AUC分别为0.814(95%CI:0.734~0.894,P<0.001),0.858(95%CI:0.784~0.931,P<0.001),0.925(95%CI:0.784~0.931,P<0.001),0.975(95%CI:0.942~1.000,P<0.001)。根据约登指数最大原则,血清NT-proBNP、hs-cTn水平与心指数预测NS患儿并发CD的最佳临界值依次为13 355 ng/L、74 ng/L、2.74 L/(min·m2),此时血清NT-proBNP、hs-cTn水平与心指数及3项指标联合预测NS患儿并发CD的敏感度分别为77.4%、58.5%、84.9%、81.1%,特异度分别为73.6%、95.4%、93.1%、96.6%。结论NHM-BIA可有效监测NS合并CD患儿的血流动力学改变。心指数联合血清NT-proBNP、hs-cTn对NS患儿并发CD有较高预测价值。
简介:神经营养因子是由神经元和神经元支配的靶器官或胶质细胞产生,在神经系统的发育、分化等生理过程中发挥重要的作用[1~3].由于神经营养因子具有维持神经元存活、促进神经元突起延伸等生理活性,并且可以在神经轴突中进行顺行、逆行性转运[4,5].因此在许多以神经元死亡或萎缩为特点的神经退行性疾病中,如老年性痴呆(Alzheimer'sdisease)、帕金森氏病(Parkinson'sdisease)、肌萎缩侧索硬化症(Amyotrophiclateralsclerosis)等,应用神经营养因子作为治疗药物有广阔的应用前景[6].
简介:摘要目的通过生物信息挖掘技术对前列腺癌基因表达谱进行分析后得到差异基因及所涉及生物学信号通路。方法使用生物信息挖掘技术对GSE46602、GSE55945、GSE69223基因表达谱芯片数据集进行分析后取交集得到差异表达基因(DEGs),后使用DAVID数据库对DEGs进行基因本体论(GO)及生物信号通路(KEGG)富集分析,使用STRING数据库及Cytoscape的cytoHubba应用程序得到蛋白互作(PPI)网络及关键基因并进行排序,最后将所得关键基因在TCGA数据库中进行验证。结果通过对GEO数据库前列腺癌的3个数据集使用R软件等工具进行分析,总共发现了225个DEGs,其中55个表达上调、170个表达下调。通过GO功能富集分析及KEGG通路分析发现这些基因富集在细胞迁移调节和血管生成等功能中,以及磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶(PI3K/Akt)和p53等信号上。构建DEGs的PPI互作网络并通过cytoHubba筛选出最重要的10个基因并与TCGA数据库数据进行对比,发现碱性螺旋环螺旋转录因子1(TWIST1)、Snail家族转录抑制因子2(SNAI2)、血管内皮生长因子受体2(KDR)等在前列腺癌发生发展中起重要作用的关键基因。结论通过深层次的生物信息挖掘或许可以让人们进一步了解前列腺癌的发生发展,为将来前列腺癌的诊断及治疗提供新的靶点。
简介:摘要目的比较多频生物电阻抗(BIA)与双能X线吸收检测法(DXA)方法测定进展期老年慢性肾脏病(CKD)患者骨骼肌量的一致性,进而为临床准确评估肌少症提供依据。方法上海市第六人民医院肾内科门诊就诊的进展期老年CKD患者接受手握力及步行速度等运动能力评定,以及DXA和多频BIA法测量身体肌肉量。采用组内相关系数、Bland-Altman分析及Kappa一致性检验评定两种肌肉测定方法的一致性。结果本研究共纳入67例老年CKD患者,年龄(70.7±6.1)岁,体质指数为(24.6±3.5)kg/m2,男性41例(61.2%),平均估算肾小球滤过率为(27.7±12.7)ml·min-1·1.73m-2。BIA和DXA测定各节段肌肉量及骨骼肌质量指数(ASMI)的组内相关系数0.81~0.90。Bland-Altman分析得出BIA较DXA方法高估患者肌肉量,ASMI平均差值为(0.44±0.13)kg/m2。此外,两种测定方法对于肌肉量减少判断呈现中度一致性(Kappa=0.47)。结论多频BIA和DXA两种测定方法对于进展期老年CKD患者肌肉量评估具有较良好的一致性,但多频BIA较DXA方法高估老年CKD患者肌肉量。
简介:摘要:目的慢性肾脏病(chronickidneydisease,CKD),尤其是终末期肾病(end-stagerenaldisease,ESRD)患者,多存在蛋白质和能量储备不足的营养不良状态。2008年国际肾脏营养与代谢协会(InternationalSocietyofRenalNutritionandMetabolism,ISRNM)提出用“蛋白质-能量消耗(protein-energywasting,PEW)”来命名这种CKD进展过程中机体蛋白质和能量储备下降的状态,这种状态可造成肌肉减少、脂肪减少或恶病质通过Meta分析发现世界多个国家和地区的PEW发病率为9.2%~81%,中位数为43%。PEW与维持性血液透析(MHD)患者的低生活质量和高死亡风险相关,也是CKD终点事件的独立危险因素。因此,及早发现并治疗PEW对MHD患者意义重大。
简介:摘要目的探讨S100P在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达、信号通路和预后关系。方法采用生物信息分析方法比对TCGA数据库中S100P基因在NSCLC患者组织中的表达情况。构建S100P蛋白-蛋白相互作用网络,探讨其相关信号通路。根据S100P基因在NSCLC患者癌组织中表达的中位数,分为高表达组和低表达组。Log-rank检验分析S100P表达与NSCLC患者预后的关系。同时回顾性分析四川省资阳市人民医院肿瘤科收治的48例NSCLC患者资料,采用免疫组织化学检测NSCLC患者癌组织和癌旁正常组织中S100P蛋白表达水平与NSCLC患者临床病理特征的关系。结果S100P蛋白在肺腺癌组织中S100P基因表达水平显著高于癌旁组织(P<0.05),且不同临床分期表达水平存在差异(F=3.74,P<0.05)。与S100P蛋白相互作用较为紧密的蛋白网络节点数50个,区域聚类指数为0.39,蛋白相互作用网络富集显著(P<0.05)。与S100P基因正相关表达最显著的基因为FURIN基因(r=0.55,P<0.05),与S100P基因负相关表达最显著的基因为CAMK1(r=-0.38,P<0.05)。S100P高表达组无疾病进展生存显著低于低表达组(HR=1.3,P<0.05)。免疫组织化学检测显示S100P蛋白在癌组织中的阳性表达与NSCLC患者的临床分期和纵隔淋巴结转移有关(P值均<0.05),而与患者年龄、性别、肿瘤大小、病理类型、病例分级和有无胸水无关(P值均>0.05)。结论S100P基因在NSCLC患者肿瘤组织中呈现高表达,并与NSCLC患者预后不良有关。
简介:目的探讨PTEN-PI3K信号转导途径中PTEN与PI3K的蛋白表达与非小细胞肺癌(NSCLC)生物学行为的关系。方法采用第二代免疫组化Elivision法和Westernblot法检测59例NSCLC组织中PTEN与PI3K的蛋白表达。结果通过Westernblot和免疫组化检测PTEN、PI3K的蛋白表达结果一致,在NSCLC组织中阳性表达率分别为55.93%(33/59)、77.97%(46/59)。NSCLC组中PTEN、PI3K蛋白的阳性表达率分别与正常肺组织和癌旁增生肺组织相比,差异均有显著性(P〈0.05)。PTEN蛋白阳性表达率与肺癌的组织学分型、分化程度无关(P〉0.05),而与淋巴结转移有关(P=0.009)。PI3K蛋白的阳性表达率与NSCLC的组织学类型无关(P〉0.05),但与细胞分化程度以及与淋巴结转移均有关(P〈0.05)。PTEN与PI3K之间具有显著负相关性(P=0.003)。结论PI3K蛋白的过表达和PTEN蛋白的低表达与肺癌的发生以及肺癌的浸润转移密切相关。PTEN蛋白的低表达可能刺激了PI3K蛋白的强表达。
简介:促红细胞生成素诱导肝细胞(Eph)受体是已知的酪氨酸蛋白激酶受体(RTKs)家族中最大的一类受体,在个体发育过程和多种疾病进程中发挥重要作用。一方面,Eph受体与其膜结合配体(Ephrin)的相互作用介导了胚胎发育到成人的一系列生理和病理过程;另一方面,Eph受体在与病原相关模式分子结合后,可参与机体感染与免疫,促进相关疾病的发生与发展。笔者就近年来Eph/Ephrin信号转导途径介导的生物学功能及相关疾病的最新研究进展进行综述,并总结Eph受体和Ephrin配体在神经系统、血管生成、肿瘤生成以及机体感染与免疫中的作用。